RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575507.1

EDC4-210, Transcript of enhancer of mRNA decapping 4, human

TSL 2

Gene EDC4, Length 570 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EDC4-210	ENST00000575507	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.99	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CUBN	O60494	3623 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	C5orf63	A6NC05	138 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TVP23A	A6NH52	213 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507		H0YL77	283 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CLU	P10909	449 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TUBG1	P23258	451 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	LIPA	P38571	399 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CRISP1	P54107	249 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HFE	Q30201	348 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	OR2T2	Q6IF00	324 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	SLC27A4	Q6P1M0	643 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PHC2	Q8IXK0	858 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	OR5AS1	Q8N127	324 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	LNX2	Q8N448	690 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	OR2Z1	Q8NG97	314 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	OR9Q1	Q8NGQ5	310 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	NRG4	Q8WWG1	115 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	COQ7	Q99807	217 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF665	Q9H7R5	613 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.98	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CLDN25	C9JDP6	229 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507		H0YJX3	145 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PLPP2	O43688	288 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	AVP	P01185	164 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	IGHV2-5	P01817	119 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	GYPB	P06028	91 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	MSMB	P08118	114 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ACSM4	P0C7M7	580 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	RAC2	P15153	192 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	POU1F1	P28069	291 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CRMP1	Q14194	572 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	SNCB	Q16143	134 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ZNF511	Q8NB15	262 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM186	Q96B77	213 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PITX2	Q99697	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HDHD2	Q9H0R4	259 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	RNF212B	A8MTL3	300 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507		F5H5K5	113 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HLA-DQA2	P01906	255 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HMGN1	P05114	100 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CDK5	Q00535	292 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	GINS1	Q14691	196 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	RAB1C	Q92928	201 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	DIRC2	Q96SL1	478 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	EGLN1	Q9GZT9	426 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	TOR3A	Q9H497	397 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		11.96	□□□□□ -0.49
EDC4-210	ENST00000575507	IGHV3-64D	A0A0J9YX35	117 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	MLNR	O43193	412 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	IFNG	P01579	166 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	GRK5	P34947	590 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	THBS2	P35442	1172 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	VHL	P40337	213 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	RGS6	P49758	472 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	OR8G5	Q8NG78	346 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	COG8	Q96MW5	612 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	MBOAT4	Q96T53	435 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	ATF6B	Q99941	703 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	MED20	Q9H944	212 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		11.95	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	FAM183A	A6NL82	134 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507		E9PQ18	207 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507		J3QW42	95 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	DLGAP1	O14490	977 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	SLC16A6	O15403	523 aa		11.94	□□□□□ -0.5
EDC4-210	ENST00000575507	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.94	□□□□□ -0.5

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