RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, human

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRIM25-208	ENST00000574234	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FZR1	Q9UM11	496 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PACSIN2	Q9UNF0	486 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ANGPTL3	Q9Y5C1	460 aa		4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NUP214	P35658	2090 aa	Predicted RBP	4.18	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	DVL1	O14640	695 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	AKR7A3	O95154	331 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CLPTM1	O96005	669 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CD55	P08174	381 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IL3	P08700	152 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TPM1	P09493	284 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	WNT2	P09544	360 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CCDC159	P0C7I6	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PRPS2	P11908	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IVD	P26440	423 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	STX2	P32856	288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	OR2B6	P58173	313 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FGF12	P61328	243 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	BTG1	P62324	171 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GNB2	P62879	340 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IFT88	Q13099	833 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FOXE3	Q13461	319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GTF2H2	Q13888	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SATL1	Q86VE3	508 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	OR5R1	Q8NH85	324 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF519	Q8TB69	540 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TSPYL1	Q9H0U9	437 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GLIPR2	Q9H4G4	154 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NANOG	Q9H9S0	305 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TAS2R7	Q9NYW3	318 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	UBXN8	O00124	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ANGPT2	O15123	496 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF208	O43345	1280 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	RIPK2	O43353	540 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	RAD51C	O43502	376 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	RAMP3	O60896	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SUPT3H	O75486	399 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	UPK3A	O75631	287 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	VAMP5	O95183	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	IGHV3-13	P01766	116 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TPM3	P06753	285 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	FBP1	P09467	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CD28	P10747	220 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ACP2	P11117	423 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TSPAN8	P19075	237 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CFHR2	P36980	270 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MDH2	P40926	338 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	MMP15	P51511	669 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP12A	P54707	1039 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	P2RX3	P56373	397 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	TPM4	P67936	248 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SKP2	Q13309	424 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZMYND11	Q15326	602 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	SPA17	Q15506	151 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	DUSP5	Q16690	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ATP6AP1L	Q52LC2	224 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GRTP1	Q5TC63	336 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234		Q75L30	129 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	GRINA	Q7Z429	371 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	ISCA2	Q86U28	154 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRIM25-208	ENST00000574234	COMTD1	Q86VU5	262 aa		4.16	□□□□□ -1.74

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms