RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR4M2Q8NGB6 313 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1J2Q8NGS2 313 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB40AQ8WXH6 277 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 GPR84Q9NQS5 396 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBCCD1Q9NVR7 557 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF319Q9P2F9 582 aa25.51■■□□□ 1.68
CTDNEP1-208ENST00000573600 A0A0U1RQV5 110 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMX1BO60663 402 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 HLA-DQB1P01920 261 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR5D14Q8NGL3 314 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR2H1Q9GZK4 316 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 ABCG5Q9H222 651 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D24Q9ULP9 559 aa25.51■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RAB11BQ15907 218 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF774Q6NX45 483 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 CMTM4Q8IZR5 234 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGLV3-1P01715 115 aa25.49■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 UBE2J2Q8N2K1 259 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 C19orf18Q8NEA5 215 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 ART1P52961 327 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 ASAH1Q13510 395 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC36A2Q495M3 483 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM166AQ6J272 317 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLPP7Q8NBV4 271 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR52H1Q8NGJ2 320 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAAR6Q96RI8 345 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 PGAP1Q75T13 922 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR1M1Q8NGA1 313 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A6Q92536 515 aa25.48■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51A2Q8NGJ7 313 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR6M1Q8NGM8 313 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 AKR7LQ8NHP1 331 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa25.47■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF529Q6P280 563 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 TMEM138Q9NPI0 162 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 GDPD3Q7L5L3 318 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR14K1Q8NGZ2 314 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 RNF121Q9H920 327 aa25.46■■□□□ 1.67
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CTDNEP1-208ENST00000573600 OR3A2P47893 321 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 INPP1P49441 399 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 CAPZA1P52907 286 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 C1orf100Q5SVJ3 147 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FBXW9Q5XUX1 488 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 OR51D1Q8NGF3 324 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM3DQ96BQ1 224 aa25.45■■□□□ 1.66
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