RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516877.1

RNU6-1234P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1234, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1234P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GNA11P29992 359 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSD17B2P37059 387 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FDFT1P37268 417 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 QARSP47897 775 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KCNJ2P63252 427 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HOXC5Q00444 222 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DHRS2Q13268 280 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 QPRTQ15274 297 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OTUD6AQ7L8S5 288 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR8H3Q8N146 312 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RNF148Q8N7C7 305 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM133AQ8N9E0 248 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C7orf34Q96L11 122 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RIT2Q99578 217 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KRT23Q9C075 422 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM117Q9H0C3 514 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM27Q9HBJ8 222 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BFARQ9NZS9 450 aa-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 A0A0B4J2C4 111 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ISPDA4D126 451 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CTAGE5O15320 804 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SERPINB7O75635 380 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FARS2O95363 451 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ERGP11308 486 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GANABQ14697 944 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C1orf220Q5T0J3 134 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB12Q6IQ22 244 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MINDY2Q8NBR6 621 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 FAM71CQ8NEG0 241 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR4X1Q8NH49 305 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 GHSRQ92847 366 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 B9D1Q9UPM9 204 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ST3GAL6Q9Y274 331 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ASB3Q9Y575 518 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LAMA4Q16363 1823 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CDHR2Q9BYE9 1310 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SLIT2O94813 1529 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 A0A0G2JQZ4 141 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CCL21O00585 134 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DPM1O60762 260 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MMP11P24347 488 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 YAP1P46937 504 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NUCB2P80303 420 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MXD1Q05195 221 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TOMM20Q15388 145 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C11orf88Q6PI97 169 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C16orf54Q6UWD8 224 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ERASQ7Z444 233 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 BCORP1Q8N888 145 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 OR4C16Q8NGL9 310 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 PANX2Q96RD6 677 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TMEM243Q9BU79 118 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 SAMD10Q9BYL1 202 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MFFQ9GZY8 342 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CES1P1Q9UKY3 287 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 RAB22AQ9UL26 194 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGF2RP11717 2491 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CACNA1AO00555 2505 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ODF3BA8MYP8 253 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 IGLL5B9A064 214 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TP53I11O14683 189 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 TAAR5O14804 337 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 DIRAS1O95057 198 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 C2P06681 752 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 LDHCP07864 332 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 CASP3P42574 277 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NUCB1Q02818 461 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ECH1Q13011 328 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 NCF4Q15080 339 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1234P-201ENST00000516877 MLIPQ5VWP3 458 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms