RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	SDR9C7	Q8NEX9	313 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	OR4F5	Q8NH21	305 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	EME1	Q96AY2	570 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	DDO	Q99489	341 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	TEX12	Q9BXU0	123 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	NUAK2	Q9H093	628 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	RERGL	Q9H628	205 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	FBXL3	Q9UKT7	428 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		11.65	□□□□□ -0.54
RBM3-208	ENST00000489344	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	OR6C68	A6NDL8	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	MGRN1	O60291	552 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	IFNG	P01579	166 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	MT-ND5	P03915	603 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SERPINA5	P05154	406 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ALPL	P05186	524 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CTLA4	P16410	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CRABP1	P29762	137 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CDA	P32320	146 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ALDH3A2	P51648	485 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SGCA	Q16586	387 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	NRN1L	Q496H8	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SKA3	Q8IX90	412 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	OR6V1	Q8N148	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SLC37A3	Q8NCC5	494 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	TSSK2	Q96PF2	358 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CDH20	Q9HBT6	801 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CMC2	Q9NRP2	79 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	B9D1	Q9UPM9	204 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		11.64	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PPL8	197 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	DCTN6	O00399	190 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SPRY3	O43610	288 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CRYBA1	P05813	215 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	LAP3	P28838	519 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	EPHA2	P29317	976 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	POLR2I	P36954	125 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF81	P51508	661 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	RAD23A	P54725	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP10-3	P60369	221 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SLC3A1	Q07837	685 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CYB561A3	Q8NBI2	242 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SH3GL3	Q99963	347 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FN3K	Q9H479	309 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SIAE	Q9HAT2	523 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	TVP23B	Q9NYZ1	205 aa		11.63	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ZAR1L	A6NP61	321 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SURF4	O15260	269 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	TSPAN15	O95858	294 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	IGHV1-46	P01743	117 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SBK2	P0C263	348 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF3	P17036	446 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CENPA	P49450	140 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	CRMP1	Q14194	572 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	SNAPC1	Q16533	368 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	MOG	Q16653	247 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC36	Q1X8D7	754 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FAM209A	Q5JX71	171 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FAM27B	Q5VT28	67 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC18	Q8N456	261 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	PTP4A1	Q93096	173 aa		11.62	□□□□□ -0.55
RBM3-208	ENST00000489344	NABP1	Q96AH0	204 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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