RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484581.6

VPS13A-211, Transcript of vacuolar protein sorting 13 homolog A, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A, Length 1,155 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-211ENST00000484581 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 OR51G1Q8NGK1 321 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ZFP90Q8TF47 636 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 LRRC29Q8WV35 223 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CDKL2Q92772 493 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 NTAN1Q96AB6 310 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 MRGPRFQ96AM1 343 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RNF185Q96GF1 192 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CPB2Q96IY4 423 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RNF145Q96MT1 663 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 REEP1Q9H902 201 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 MTFP1Q9UDX5 166 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CD300AQ9UGN4 299 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CD84Q9UIB8 345 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 PSG8Q9UQ74 426 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.14□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 FHOD3Q2V2M9 1422 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 A0A0A6YYD5 115 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SYCE1LA8MT33 242 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DFFAO00273 331 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ZMPSTE24O75844 475 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SC5DO75845 299 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TRAPPC6AO75865 159 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 LY6G6DO95868 133 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IGLV1-47P01700 117 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CD3GP09693 182 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RAB3AP20336 220 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CCNE1P24864 410 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ARR3P36575 388 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CEACAM6P40199 344 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CDKN2BP42772 138 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CYB561P49447 251 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 OR2B8PP59922 312 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 HERVK_113P61574 105 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 KIR2DS1Q14954 304 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ANGPT1Q15389 498 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TNXAQ16473 311 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DUPD1Q68J44 220 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CLEC6AQ6EIG7 209 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 LINC00469Q8N7U9 141 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 NRTNQ99748 197 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SLC25A2Q9BXI2 301 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 GOLPH3Q9H4A6 298 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 FAM49BQ9NUQ9 324 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DEC1Q9P2X7 70 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa3.13□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 A0A0B4J2E0 115 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 MGAT4DA6NG13 374 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 IQCF5A8MTL0 148 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 YEATS4O95619 227 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 CST4P01036 141 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RPN2P04844 631 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 KLK2P20151 261 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 AZU1P20160 251 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ARL2P36404 184 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 NUDT1P36639 197 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 P2RX1P51575 399 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 UBE2E1P51965 193 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 HCCSP53701 268 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 GNB2P62879 340 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ST3GAL4Q11206 333 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ZNF266Q14584 549 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RGNQ15493 299 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TAL2Q16559 108 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM183BQ1AE95 376 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 SPAG16Q8N0X2 631 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 DAW1Q8N136 415 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 ANGPTL6Q8NI99 470 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 TMEM234Q8WY98 164 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 UBE2E2Q96LR5 201 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 MED4Q9NPJ6 270 aa3.12□□□□□ -1.91
VPS13A-211ENST00000484581 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms