RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 BET1O15155 118 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MPC2O95563 127 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IFNA6P05013 189 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ACSM4P0C7M7 580 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 VSIG10L2P0DP72 767 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MGMTP16455 207 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF43P17038 809 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NAT1P18440 290 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CCL1P22362 96 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ECI1P42126 302 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ALDH3B1P43353 468 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EFNB2P52799 333 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 BIDP55957 195 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FBXW4P57775 412 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RPS15P62841 145 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 UBA52P62987 128 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GABREP78334 506 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRR20EP86478 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRR20CP86479 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRR20DP86480 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRR20BP86481 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRR20AP86496 221 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MYBPHQ13203 477 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MELKQ14680 651 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 POU4F3Q15319 338 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ETFDHQ16134 617 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 HIST3H3Q16695 136 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CDNFQ49AH0 187 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SIGIRRQ6IA17 410 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 COMMD7Q86VX2 200 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM17Q86X19 198 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PRSS58Q8IYP2 241 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FADS6Q8N9I5 356 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PLPP7Q8NBV4 271 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NOXO1Q8NFA2 376 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR2M3Q8NG83 312 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR4K17Q8NGC6 315 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 M1APQ8TC57 530 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 C11orf40Q8WZ69 217 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FGGYQ96C11 551 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 OR6C1Q96RD1 312 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PHB2Q99623 299 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CRB3Q9BUF7 120 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CHIAQ9BZP6 476 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 BEX1Q9HBH7 125 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A0U1RQV5 110 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 A0A1B0GTI1 187 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AQP7P3A6NL99 342 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 DHRS7CA6NNS2 312 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TMEM14DPA8MWL7 114 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 NUDT19A8MXV4 375 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 H0YC42 278 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RAB27BO00194 218 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 GPANK1O95872 356 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 IL2RAP01589 272 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 TTRP02766 147 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FCER2P06734 321 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF735P0CB33 412 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PGA4P0DJD7 388 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PGA3P0DJD8 388 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CXCL2P19875 107 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 SDHBP21912 280 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 PI4KAP42356 2102 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 RPS27P42677 84 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 EFNA3P52797 238 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CLDN6P56747 220 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 CXADRP78310 365 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 QRFPP83859 136 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 FOXF1Q12946 379 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 AANATQ16613 207 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 ODF4Q2M2E3 257 aa7.56□□□□□ -1.2
ACTB-208ENST00000464611 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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