RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461350.5

COPS7B-217, Transcript of COP9 signalosome subunit 7B, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7B, Length 3,299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7B-217ENST00000461350 BIVMQ86UB2 503 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CCDC36Q8IYA8 594 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PLPP7Q8NBV4 271 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 DEFB124Q8NES8 71 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR5T2Q8NGG2 359 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR1J2Q8NGS2 313 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ELP5Q8TE02 316 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CDC6Q99741 560 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 DNTTIP1Q9H147 329 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GRHPRQ9UBQ7 328 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 LOC400499M0QZD8 3231 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 LOC100509620A0A075B734 347 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SHISA8B8ZZ34 492 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CD34P28906 385 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SHEQ5VZ18 495 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR2W3Q7Z3T1 314 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GALNT16Q8N428 558 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 IMMP1LQ96LU5 166 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 FOXN4Q96NZ1 517 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 MNTQ99583 582 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 TCFL5Q9UL49 500 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 VDAC3Q9Y277 283 aa10□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR14I1A6ND48 311 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PRR33A8MZF0 331 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GPR31O00270 319 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ITGB2P05107 769 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PNMTP11086 282 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PGCP20142 388 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CXCR1P25024 350 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 DLSTP36957 453 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SLC6A8P48029 635 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SCAND1P57086 179 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 NDUFAF7Q7L592 441 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CDC20BQ86Y33 519 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PRSS33Q8NF86 280 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ADAM19Q9H013 955 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ASF1BQ9NVP2 202 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 MPTX1A8MV57 137 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 F5H0A9 414 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ABCD4O14678 606 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GP1BBP13224 206 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SDHAP31040 664 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SLC25A1P53007 311 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 WDR38Q5JTN6 314 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PRAMEF20Q5VT98 475 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 MOB3CQ70IA8 216 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SLC35D2Q76EJ3 337 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PRSS35Q8N3Z0 413 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 KCNRGQ8N5I3 272 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GPR119Q8TDV5 335 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 TAAR8Q969N4 342 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR11A1Q9GZK7 315 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SYT4Q9H2B2 425 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 DOCK10Q96BY6 2186 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CYB5AP00167 134 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 DHRS2Q13268 280 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 NKPD1Q17RQ9 610 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GPX8Q8TED1 209 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OIT3Q8WWZ8 545 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ASB13Q8WXK3 278 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 INTS14Q96SY0 518 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 AMELYQ99218 206 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SLC22A13Q9Y226 551 aa9.99□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR2AT4A6NND4 320 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SLC17A2O00624 439 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 BCL2L11O43521 198 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ALOX5APP20292 161 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 KIR3DL2P43630 455 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ZNF74Q16587 644 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 RAB12Q6IQ22 244 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 C11orf87Q6NUJ2 197 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.98□□□□□ -0.81
COPS7B-217ENST00000461350 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms