RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, human

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDLBP-222	ENST00000449504	MSR1	P21757	451 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	IL12A	P29459	219 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ECHS1	P30084	290 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RGS6	P49758	472 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RAB13	P51153	203 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	IKZF1	Q13422	519 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZSCAN26	Q16670	478 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	HHAT	Q5VTY9	493 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	FBXW12	Q6X9E4	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF826P	Q6ZT77	177 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TMEM219	Q86XT9	240 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00482	Q8N8I6	264 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	NFKBID	Q8NI38	313 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TNFRSF14	Q92956	283 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ITFG2	Q969R8	447 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	VPS33A	Q96AX1	596 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RASD2	Q96D21	266 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZBTB18	Q99592	522 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	C1orf123	Q9NWV4	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	GMNC	A6NCL1	334 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		A6NLC8	198 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		H0YHG0	523 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		M0R3H8	397 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	F2RL2	O00254	374 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	NDUFB3	O43676	98 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CHP2	O43745	196 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	GRP	P07492	148 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	NR2C1	P13056	603 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ETS2	P15036	469 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	FUT1	P19526	365 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	POU1F1	P28069	291 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	AQP1	P29972	269 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CD200	P41217	278 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RAD23A	P54725	363 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	BLCAP	P62952	87 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	OR8G1	Q15617	311 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	LINC00114	Q6XXX2	140 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	COLCA1	Q6ZS62	124 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SYT9	Q86SS6	491 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	KRT73	Q86Y46	540 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		Q8N2B8	174 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	PIFO	Q8TCI5	191 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	MYDGF	Q969H8	173 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SPATA5L1	Q9BVQ7	753 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RAD21L1	Q9H4I0	556 aa		5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZMAT5	Q9UDW3	170 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		A0A1W2PQ09	198 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ERICH4	A6NGS2	130 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504		H0YAE9	185 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ITM2A	O43736	263 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	THY1	P04216	161 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	BGN	P21810	368 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	CA6	P23280	308 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	GSK3B	P49841	420 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	BLMH	Q13867	455 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	RGN	Q15493	299 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF613	Q6PF04	617 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	ZNF781	Q8N8C0	355 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SMYD1	Q8NB12	490 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
HDLBP-222	ENST00000449504	APOBEC3D	Q96AK3	386 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48

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