RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LINC01560Q8TB33 94 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABHD4Q8TB40 342 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM222BQ8WU58 562 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC7A6Q92536 515 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RADILQ96JH8 1075 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C4orf45Q96LM5 186 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5M11Q96RB7 305 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MGLLQ99685 303 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BCL2L14Q9BZR8 327 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RGCCQ9H4X1 137 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OPA3Q9H6K4 179 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POU2F3Q9UKI9 436 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.9□□□□□ -0.98
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LOC100509620A0A075B734 347 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A1B0GVI7 797 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WIPF3A6NGB9 483 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 VSTM5A8MXK1 200 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRR32B1ATL7 298 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 XRCC2O43543 280 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THBDP07204 575 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD3EP07766 207 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADRA2AP08913 450 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM18P0DKX4 95 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC2A1P11166 492 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCL2P13500 99 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CELP19835 753 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCMT1P22061 227 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TUBG1P23258 451 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCR9P51686 369 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDK5R1Q15078 307 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARMCX4Q5H9R4 360 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FDX2Q6P4F2 183 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC22A25Q6T423 547 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF584Q8IVC4 421 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR2G2Q8NGZ5 317 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR5AK2Q8NH90 309 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 THRSPQ92748 146 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MUL1Q969V5 352 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMIM19Q96E16 107 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF649Q9BS31 505 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PBOV1Q9GZY1 135 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TUBG2Q9NRH3 451 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TBCCD1Q9NVR7 557 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM206AQ9NX38 181 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPAP1Q9NZP6 1156 aa8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCRL2O00421 344 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCD4O14678 606 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPRIN2O60269 458 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NOL3O60936 208 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GOSR1O95249 250 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATE1O95260 518 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SERPINA3P01011 423 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF12P17014 697 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTKP33981 857 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SELENOVP59797 346 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BSPH1Q075Z2 132 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SLC3A1Q07837 685 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR50Q13585 617 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAM1Q15629 374 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSTQ16762 297 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR38Q5JTN6 314 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TMEM244Q5VVB8 128 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LIPKQ5VXJ0 399 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPR141Q7Z602 305 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF75AQ96N20 296 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 OR51B6Q9H340 312 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.88□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CACNA1CQ13936 2221 aa8.87□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 A0A0U1RQV5 110 aa8.87□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms