RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 OR14C36Q8NHC7 312 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FBRSQ9HAH7 460 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R4Q9NYW5 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF581Q9P0T4 197 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MSRAQ9UJ68 235 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf52A6NGY3 159 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 APOC3P02656 99 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF43P17038 809 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R19P59542 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GLT8D1Q68CQ7 371 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC29A4Q7RTT9 530 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MARCH3Q86UD3 253 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BAP18Q8IXM2 172 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GLYATL2Q8WU03 294 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF416Q9BWM5 594 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FOXQ1Q9C009 403 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 Q9N2J8 555 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK5Q92824 1860 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MUC6Q6W4X9 2439 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINI2O75830 405 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KLK2P20151 261 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ3P48549 501 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTBP60709 375 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACTG1P63261 375 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PXT1Q8NFP0 134 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF671Q8TAW3 534 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C9orf170A2RU37 121 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAP1O75689 374 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 GLAP06280 429 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF44P15621 663 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CCKBRP32239 447 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CA8P35219 290 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DHRS11Q6UWP2 260 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NABP1Q96AH0 204 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CHIAQ9BZP6 476 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOIQ9C0D9 397 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PIGMQ9H3S5 423 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MT-ATP6P00846 226 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NTF4P34130 210 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGDIBP52566 201 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HYAL1Q12794 435 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC18BQ6UXF7 455 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ETV3LQ6ZN32 361 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF546Q86UE3 836 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MISPQ8IVT2 679 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UQCC1Q9NVA1 299 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5AC2Q9NZP5 309 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NDRG3Q9UGV2 375 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PI4KAP42356 2102 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CCSO14618 274 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CA11O75493 328 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB3DO95716 219 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRF1P14222 555 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 COX15Q7KZN9 410 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF440Q8IYI8 595 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC46Q96FV0 321 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX12Q9BXU0 123 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF69Q9UC07 566 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC13A4Q9UKG4 626 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 R4GMQ9 66 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SVILO95425 2214 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CACNA1DQ01668 2161 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0D9SG52 128 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPDEFO95238 335 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UTS2O95399 124 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXB2P14652 356 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ERV3-1Q14264 604 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf140Q5VVS0 124 aa3.2□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK20Q8IZL9 346 aa3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms