RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF208O43345 1280 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CYTIPO60759 359 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PAGE4O60829 102 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OR5F1O95221 314 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 STAMBPO95630 424 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 HPRP00739 348 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 BGLAPP02818 100 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 THY1P04216 161 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 GPIP06744 558 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CRHP06850 196 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 YES1P07947 543 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PNMTP11086 282 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SELLP14151 372 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 FUT1P19526 365 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 AGAP20933 346 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 EDNRAP25101 427 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 POU1F1P28069 291 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CLK1P49759 484 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 UGT2B15P54855 530 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 VLDLRP98155 873 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SPIBQ01892 262 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TFF3Q07654 80 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 LGALS3BPQ08380 585 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ITGADQ13349 1161 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PMS2P3Q13401 168 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TRAM2Q15035 370 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TSC22D1Q15714 1073 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CTF1Q16619 201 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 C14orf177Q52M58 125 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM225Q6GV28 225 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF613Q6PF04 617 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC121Q6ZUS5 278 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 NKAIN4Q8IVV8 208 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 UBE2J2Q8N2K1 259 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SLC43A2Q8N370 569 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 LRRC17Q8N6Y2 441 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 Q8NFD4 153 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PFN4Q8NHR9 129 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PIGXQ8TBF5 258 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 STARD4Q96DR4 205 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PRRC1Q96M27 445 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PSD2Q9BQI7 771 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PRSS27Q9BQR3 290 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 POTEKPQ9BYX7 375 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PIGMQ9H3S5 423 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CHST11Q9NPF2 352 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TAS2R1Q9NYW7 299 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 EMC3Q9P0I2 261 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL9Q9P2J3 617 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 CD300AQ9UGN4 299 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 A4GNTQ9UNA3 340 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 HIVEP1P15822 2718 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 GPR171O14626 319 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 FFAR1O14842 300 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OR2T1O43869 369 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 NPIPB7O75200 414 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 RAD51DO75771 328 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 LYZL6O75951 148 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 KRT33AO76009 404 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 OR6A2O95222 327 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 HIST1H2ABP04908 130 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 FABP3P05413 133 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 H1F0P07305 194 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 ADORA3P0DMS8 318 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 IFI30P13284 250 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 POU2F1P14859 743 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 GABRB1P18505 474 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRK-209ENST00000415046 EDN2P20800 178 aa3.78□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms