RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 Q499Y3 187 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 AKIRIN2Q53H80 203 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 STPG1Q5TH74 334 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 NHLRC1Q6VVB1 395 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 STPG2Q8N412 459 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF676Q8N7Q3 588 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR52N5Q8NH56 324 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ORAI1Q96D31 301 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DERL3Q96Q80 235 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ABHD6Q9BV23 337 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 REG4Q9BYZ8 158 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR51B6Q9H340 312 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PRR33A8MZF0 331 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 KRBOX1C9JBD0 128 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PGA4P0DJD7 388 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PGA3P0DJD8 388 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SRMP19623 302 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ITGA3P26006 1051 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 THBS2P35442 1172 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 KCNJ3P48549 501 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 EVX1P49640 407 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ROM1Q03395 351 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 IL18Q14116 193 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 BAK1Q16611 211 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DCAF10Q5QP82 559 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ABHD17BQ5VST6 288 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 CARD17Q5XLA6 110 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DEGS2Q6QHC5 323 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00346Q8IVM7 164 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 GLB1L2Q8IW92 636 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SAMD12Q8N8I0 201 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR14L1PQ8NHC6 308 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 C4orf45Q96LM5 186 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DCBLD2Q96PD2 775 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SLC25A18Q9H1K4 315 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LRFN1Q9P244 771 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 KLHL13Q9P2N7 655 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 IL17BQ9UHF5 180 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PPL8 197 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 GJE1A6NN92 205 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF726A6NNF4 738 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PIN1P1O15428 100 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP3O75074 770 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF432O94892 652 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 WNT11O96014 354 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 HRGP04196 525 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 FTH1P19P0C7X4 201 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ELK1P19419 428 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 CASRP41180 1078 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 RFX2P48378 723 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SOX2P48431 317 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 FGL1Q08830 312 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 WDR38Q5JTN6 314 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DCXRQ7Z4W1 244 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 OR6X1Q8NH79 312 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 RNF128Q8TEB7 428 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 RHOVQ96L33 236 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 DEPPQ9NTK1 212 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 SDHAF2Q9NX18 166 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 ABI3Q9P2A4 366 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP12Q9Y561 859 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 MED13Q9UHV7 2174 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PQ09 198 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 LRRC3CA6NJW4 275 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 H3BSH0 61 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 PDCD5O14737 125 aa8.88□□□□□ -0.99
LRRTM4-202ENST00000409093 TNFSF11O14788 317 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms