RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 C22orf42Q6IC83 251 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 H3F3CQ6NXT2 135 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf54Q6X4T0 127 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CMC1Q7Z7K0 106 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBLN2Q8IUK8 224 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM71AQ8IYT1 594 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 GPR26Q8NDV2 337 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1orf64Q8NEQ6 169 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR5T1Q8NG75 326 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4A4PQ8NGN8 299 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF145Q96MT1 663 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ANGPTL4Q9BY76 406 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM27Q9HBJ8 222 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RETNQ9HD89 108 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 MED4Q9NPJ6 270 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 MTCH1Q9NZJ7 389 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC17A7Q9P2U7 560 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF391Q9UJN7 358 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP1.14□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF407Q9C0G0 2248 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PNN7 141 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 XKRY2A2RUG3 117 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDZK1P1A8MUH7 402 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NDUFAB1O14561 156 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF13O43567 381 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PAHP00439 452 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 LHBP01229 141 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RRM2P31350 389 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAB10P61026 200 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SIGLEC14Q08ET2 396 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 BAMBIQ13145 260 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM53BQ14153 422 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAM2Q15035 370 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NCF4Q15080 339 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PGGHGQ32M88 737 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 YIF1BQ5BJH7 314 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CASP12Q6UXS9 341 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM136Q6ZRR5 245 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CBR4Q8N4T8 237 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM104Q8NE00 496 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR4M1Q8NGD0 313 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR10G6Q8NH81 332 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 LYPD6BQ8NI32 183 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR51E1Q8TCB6 317 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TVP23CQ96ET8 276 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NRBF2Q96F24 287 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPD52L3Q96J77 140 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 C18orf15Q96N68 181 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZFP3Q96NJ6 502 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHOXF2Q9BQY4 288 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM243Q9BU79 118 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHCHD7Q9BUK0 85 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUP58Q9BVL2 599 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM165Q9HC07 324 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RHBDL2Q9NX52 303 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF586Q9NXT0 402 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PITPNC1Q9UKF7 332 aa1.13□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 LTBP4Q8N2S1 1624 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
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RNU6-227P-201ENST00000362865 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SMCO3A2RU48 225 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA8OA6NCC3 632 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 GOLGA8NF8WBI6 632 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TNFRSF11BO00300 401 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMT2O60551 498 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PLIN3O60664 434 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SERPINB7O75635 380 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL32P24001 234 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMB5P28074 263 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 BMI1P35226 326 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TALDO1P37837 337 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAS2R46P59540 309 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PNOCQ13519 176 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMC1Q14565 340 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRAMEF20Q5VT98 475 aa1.12□□□□□ -2.23
RNU6-227P-201ENST00000362865 SNX31Q8N9S9 440 aa1.12□□□□□ -2.23
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