RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284273.5

UBASH3B-201, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBASH3B, Length 6,912 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-201ENST00000284273 CORINQ9Y5Q5 1042 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LCN15Q6UWW0 184 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 BTNL3Q6UXE8 466 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM99Q8N816 258 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 C15orf54Q8N8G6 183 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR1L3Q8NH93 324 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR8B4Q96RC9 309 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 A4GALTQ9NPC4 353 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 MED9Q9NWA0 146 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 A0A087WV62 115 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SOD1P00441 154 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 COL9A1P20849 921 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LHX8Q68G74 356 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM123Q8N131 208 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 CHST2Q9Y4C5 530 aa10.75□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TUBAL3A6NHL2 446 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ACSM6Q6P461 480 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 DOK3Q7L591 496 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 MORN4Q8NDC4 146 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OXGR1Q96P68 337 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFRSF10CO14798 259 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 FCMRO60667 390 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PENKP01210 267 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 CEACAM5P06731 702 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC6A12P48065 614 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PSMB3P49720 205 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 GSG1Q2KHT4 349 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF573Q86YE8 665 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR2G3Q8NGZ4 309 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 NEURL3Q96EH8 262 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OPALINQ96PE5 141 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 BCO1Q9HAY6 547 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 HMGN4O00479 90 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 DHRS4L1P0CG22 281 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 FAHP16930 419 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ACKR3P25106 362 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 GSCP56915 257 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 FOXL2P58012 376 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR51S1Q8NGJ8 323 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 GLTPQ9NZD2 209 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SELENBP1Q13228 472 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TMEM268Q5VZI3 342 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PIK3IP1Q96FE7 263 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 COA4Q9NYJ1 87 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 CROCCQ5TZA2 2017 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC16A6O15403 523 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 THEM4Q5T1C6 240 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SPRED1Q7Z699 444 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 NDFIP1Q9BT67 221 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PPIL1Q9Y3C6 166 aa10.74□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TRAV17A0A0B4J275 112 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 H3BP45 60 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TMPRSS2O15393 492 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 CCL4P13236 92 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 GGTLC2Q14390 218 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SIAH3Q8IW03 269 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SFTPA2Q8IWL1 248 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 LYG1Q8N1E2 194 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4F5Q8NH21 305 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 OR4F4Q96R69 305 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SOX7Q9BT81 388 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 RNF167Q9H6Y7 350 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ISYNA1Q9NPH2 558 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 HPNP05981 417 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 BMP2P12643 396 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 MMP11P24347 488 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 APEX1P27695 318 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 AFMIDQ63HM1 303 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 NUDT9Q9BW91 350 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SLC25A22Q9H936 323 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 INPP5EQ9NRR6 644 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 RAB22AQ9UL26 194 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 SCN11AQ9UI33 1791 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 G0S2P27469 103 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 Q1RN00 199 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PRSS41Q7RTY9 318 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 NRTNQ99748 197 aa10.73□□□□□ -0.69
UBASH3B-201ENST00000284273 PBOV1Q9GZY1 135 aa10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms