RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635152.1

BRF1-222, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 2

Gene BRF1, Length 2,876 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-222	ENST00000635152	SLC22A6	Q4U2R8	563 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf198	Q9H425	327 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	KLK13	Q9UKR3	277 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SIT1	Q9Y3P8	196 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152		U3KQA8	63 aa		11.65	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TTLL8	A6PVC2	850 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	GABRA1	P14867	456 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ANOS1	P23352	680 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TTC9	Q92623	222 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CCDC120	Q96HB5	630 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	RASL10B	Q96S79	203 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM82	A0PJX8	343 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152		F5H5P2	479 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF250	P15622	560 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	LAP3	P28838	519 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	HSD11B1	P28845	292 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	BDKRB2	P30411	391 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PXDC1	Q5TGL8	231 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR52W1	Q6IF63	320 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR6S1	Q8NH40	331 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	DUSP23	Q9BVJ7	150 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	GSX2	Q9BZM3	304 aa		11.64	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	POM121C	A8CG34	1229 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	RER1	O15258	196 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TSPAN9	O75954	239 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR4E1	P0C645	316 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ABO	P16442	354 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TAF13	Q15543	124 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	HLA-B	Q31612	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	C3orf33	Q6P1S2	294 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	BPIFB2	Q8N4F0	458 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ARL6	Q9H0F7	186 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	LDLRAD4	O15165	306 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SORD	Q00796	357 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	UNC119	Q13432	240 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CDNF	Q49AH0	187 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CLLU1	Q5K131	121 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SAP25	Q8TEE9	199 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SLC6A7	Q99884	636 aa		11.63	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152		G3V3Y1	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TEX46	H3BTG2	121 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	IGHG1	P01857	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CFI	P05156	583 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF43	P17038	809 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	THEM4	Q5T1C6	240 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SLC51B	Q86UW2	128 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	SPACA9	Q96E40	222 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	TEX51	A0A1B0GUA7	166 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152		B8ZZF3	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	MASP2	O00187	686 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	RAB27B	O00194	218 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PDGFA	P04085	211 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	ITGB2	P05107	769 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PGA4	P0DJD7	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	PGA3	P0DJD8	388 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	GNB3	P16520	340 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	NAGA	P17050	411 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	CLDN6	P56747	220 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.62	□□□□□ -0.55
BRF1-222	ENST00000635152	AWAT2	Q6E213	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55

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