RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617904.4

TRAPPC3-210, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,305 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-210ENST00000617904 SRMP19623 302 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TPTEP56180 551 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 C3AR1Q16581 482 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PHYHD1Q5SRE7 291 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM53Q6P2H8 277 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 GPR137Q96N19 417 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TEX15Q9BXT5 2789 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOTCH2Q04721 2471 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.75□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 A0A1B0GTH9 108 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOTOA8MTQ0 251 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRR32B1ATL7 298 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLDN1O95832 211 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CTSSP25774 331 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 COL8A1P27658 744 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 AGTR1P30556 359 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ARR3P36575 388 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TALDO1P37837 337 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 BMXP51813 675 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIST1H3AP68431 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CFAP77Q6ZQR2 320 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 HIST2H3AQ71DI3 136 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SIAH3Q8IW03 269 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR13C3Q8NGS6 347 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NABP1Q96AH0 204 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DERL3Q96Q80 235 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SH3GL3Q99963 347 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NEK6Q9HC98 313 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NOX4Q9NPH5 578 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ATPIF1Q9UII2 106 aa14.74□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 MEGF11A6BM72 1044 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR6C6A6NF89 314 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANXA2P2A6NMY6 339 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 RER1O15258 196 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CRHP06850 196 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CD40LGP29965 261 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 KIR3DL2P43630 455 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC6A9P48067 706 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CX3CR1P49238 355 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PER3P56645 1201 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PLP2Q04941 152 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FBXW9Q5XUX1 488 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAM214BQ7L5A3 538 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 COMMD2Q86X83 199 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRSS35Q8N3Z0 413 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 HSD17B8Q92506 261 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TMEM106AQ96A25 262 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PGAM5Q96HS1 289 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZFP3Q96NJ6 502 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PBOV1Q9GZY1 135 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC7A10Q9NS82 523 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ABRACLQ9P1F3 81 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF391Q9UJN7 358 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CACNA1DQ01668 2161 aa14.73□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SYT7O43581 403 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DOK2O60496 412 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 B4GALT1P15291 398 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 MPGP29372 298 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR3A2P47893 321 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SOX2P48431 317 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 PRKXP51817 358 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 CAPZA1P52907 286 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 GALK2Q01415 458 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 RBPJQ06330 500 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FAPQ12884 760 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 IDNKQ5T6J7 187 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OTPQ5XKR4 325 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ZNF787Q6DD87 383 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DRAM2Q6UX65 266 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR52H1Q8NGJ2 320 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 ITFG2Q969R8 447 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 WDFY2Q96P53 400 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 TAAR6Q96RI8 345 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC30A2Q9BRI3 323 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC24A3Q9HC58 644 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 BRD7Q9NPI1 651 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 RABL2BQ9UNT1 228 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 FOXJ3Q9UPW0 622 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 SLC5A6Q9Y289 635 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.72□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa14.71□□□□□ -0.05
TRAPPC3-210ENST00000617904 LRRTM2O43300 516 aa14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms