RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 B3GALT2O43825 422 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CPN1P15169 458 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NFYBP25208 207 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 EPHA2P29317 976 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RANP62826 216 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF79Q15937 498 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PCK2Q16822 640 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IFI44LQ53G44 452 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IDNKQ5T6J7 187 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 FAM198BQ6UWH4 519 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RNF130Q86XS8 419 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SLC41A3Q96GZ6 507 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TP53RKQ96S44 253 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IL21RQ9HBE5 538 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TPRKBQ9Y3C4 175 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NUMA1Q14980 2115 aa6.85□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 A0A087WUJ7 227 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GJE1A6NN92 205 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 GDF9O60383 454 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HMGA2P52926 109 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ERVFRD-1P60508 538 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZP4Q12836 540 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CRMP1Q14194 572 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 C1QL4Q86Z23 238 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR5P2Q8WZ92 322 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 NEURL3Q96EH8 262 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CD180Q99467 661 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CXorf36Q9H7Y0 433 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR1A2Q9Y585 309 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 V9GYH0 126 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 REV3LO60673 3130 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR11H12B2RN74 326 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 K7ERU9 68 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RFXAPO00287 272 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CTSVO60911 334 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 AMBPP02760 352 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OPN1SWP03999 348 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 APODP05090 189 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TSPAN19P0C672 248 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 JMJD7P0C870 316 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CD37P11049 281 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TNFSF8P32971 234 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 RAB7AP51149 207 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 CDH12P55289 794 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 PSG6Q00889 435 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZNF605Q86T29 641 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR11H1Q8NG94 326 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR11H2Q8NH07 326 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 OR5AK3PQ8NH89 298 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 APH1BQ8WW43 257 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ELSPBP1Q96BH3 223 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 SFRP2Q96HF1 295 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 TIMM29Q9BSF4 260 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.84□□□□□ -1.31
HCG18-244ENST00000602516 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 A0A1W2PP55 124 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 FEZF1A0PJY2 475 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TNFRSF11BO00300 401 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 AQP7O14520 342 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 MMP23AO75900 390 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR6A2O95222 327 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 OR8U9P0C7N5 309 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TNFRSF1BP20333 461 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 MAKP20794 623 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 AKT2P31751 481 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 XCR1P46094 333 aa6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HCG18-244ENST00000602516 TPBGQ13641 420 aa6.83□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.4 ms