RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CORO6Q6QEF8 472 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TREML4Q6UXN2 200 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF620Q6ZNG0 422 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 USP51Q70EK9 711 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR6V1Q8N148 313 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PACRGLQ8N7B6 248 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LINC01356Q8N9X3 169 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 AQP11Q8NBQ7 271 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SDR9C7Q8NEX9 313 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR2T29Q8NH02 315 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR1F12Q8NHA8 337 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SLC7A6Q92536 515 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCL17Q92583 94 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HPS1Q92902 700 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 YIPF5Q969M3 257 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ASB9Q96DX5 294 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 COG8Q96MW5 612 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PITX2Q99697 317 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PKP2Q99959 881 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TSSK6Q9BXA6 273 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 EGLN1Q9GZT9 426 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FN3KQ9H479 309 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SAP30LQ9HAJ7 183 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MSL2Q9HCI7 577 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PALMDQ9NP74 551 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 C8orf4Q9NR00 106 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D23Q9NUY8 699 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ATRQ13535 2644 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087WXM4 84 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C6A6NF89 314 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC160A6NGH7 325 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CST1P01037 141 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGHV1-46P01743 117 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DBHP09172 617 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RAP2AP10114 183 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TUBG1P23258 451 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TNFSF4P23510 183 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IL2RGP31785 369 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CRYBB2P43320 205 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MAGEA2P43356 314 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MMP15P51511 669 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PSG7Q13046 419 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FLOT2Q14254 428 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 KCNMB1Q16558 191 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZMAT1Q5H9K5 638 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FAM209AQ5JX71 171 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 FAM120AOSQ5T036 256 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 AVPI1Q5T686 147 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IL17RELQ6ZVW7 336 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LINC00346Q8IVM7 164 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 NPEPL1Q8NDH3 523 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PROKR2Q8NFJ6 384 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 OR5L1Q8NGL2 311 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CLDND2Q8NHS1 167 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PTP4A1Q93096 173 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 BORCS5Q969J3 196 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CMBLQ96DG6 245 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TIMD4Q96H15 378 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CNBD2Q96M20 576 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 DIRC2Q96SL1 478 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 SOX7Q9BT81 388 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CHID1Q9BWS9 393 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD60Q9BZ19 345 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 RACGAP1Q9H0H5 632 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 HDHD2Q9H0R4 259 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 LPAR2Q9HBW0 351 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM160Q9NX00 188 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 PTTG3PQ9NZH4 202 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 STARD10Q9Y365 291 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRM-214ENST00000583153 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ISPDA4D126 451 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 OR6C68A6NDL8 312 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 B4DSR2 109 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRM-214ENST00000583153 CLDN25C9JDP6 229 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms