RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 MND1Q9BWT6 205 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 CRIM1Q9NZV1 1036 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 IKZF2Q9UKS7 526 aa9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 ABCA4P78363 2273 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 PKDREJQ9NTG1 2253 aa9.96□□□□□ -0.81
GGA3-211ENST00000582232 C5orf49A4QMS7 147 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 DPRXA6NFQ7 191 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CYSRT1A8MQ03 144 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PRSS44E7EML9 344 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 J3QLW9 94 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 M0R135 149 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 M0R1B8 84 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PSMD9O00233 223 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CASKO14936 926 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MYL12BO14950 172 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CRYAAP02489 173 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MT-ND5P03915 603 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 DBHP09172 617 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ZNF19P17023 458 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 HSD11B1P28845 292 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TGM4P49221 684 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 RGS6P49758 472 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 NR1H2P55055 460 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CDH15P55291 814 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 WNT4P56705 351 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ACSM1Q08AH1 577 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TP53I3Q53FA7 332 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ARL9Q6T311 187 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SPATC1Q76KD6 591 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 FAM220AQ7Z4H9 259 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SPARTQ8N0X7 666 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SVOPQ8N4V2 548 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 YIPF7Q8N8F6 280 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TSPAN14Q8NG11 270 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SLC7A6Q92536 515 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PELI1Q96FA3 418 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ZNF799Q96GE5 643 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 RADILQ96JH8 1075 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 C4orf36Q96KX1 117 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 DOK1Q99704 481 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TTTY10Q9BZA0 68 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SP140LQ9H930 580 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TBCCD1Q9NVR7 557 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 BABAM2Q9NXR7 383 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 GNG8Q9UK08 70 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SNX5Q9Y5X3 404 aa9.96□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 A0A087WXM4 84 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MAGEA13PA6NCF6 341 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 DEFB108AA8MXU0 73 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 F5H5K5 113 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CCL2P13500 99 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PCMT1P22061 227 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TUBG1P23258 451 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 LOXP28300 417 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CALCRP30988 508 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 WNT5AP41221 380 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CX3CR1P49238 355 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PRKXP51817 358 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 GALK2Q01415 458 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 BDH1Q02338 343 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 HGFACQ04756 655 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 BSPH1Q075Z2 132 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SPHARQ15513 63 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CCDC58Q4VC31 144 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ZNF283Q8N7M2 679 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 RORBQ92753 470 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 C4orf45Q96LM5 186 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 COG8Q96MW5 612 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TMEM204Q9BSN7 226 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 MOB1AQ9H8S9 216 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 CDH20Q9HBT6 801 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ISYNA1Q9NPH2 558 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ACOT13Q9NPJ3 140 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 G6PC2Q9NQR9 355 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 TUBG2Q9NRH3 451 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 ACOXLQ9NUZ1 547 aa9.95□□□□□ -0.82
GGA3-211ENST00000582232 FAM206AQ9NX38 181 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms