RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547201.5

USP25-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 757 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-209ENST00000547201 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 FBXL3Q9UKT7 428 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 B9D1Q9UPM9 204 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MOKQ9UQ07 419 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ITPR2Q14571 2701 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PLCE1Q9P212 2302 aa4.77□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CIB4A0PJX0 185 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ZNF726A6NNF4 738 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ABCD4O14678 606 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ARPC3O15145 178 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 VAMP5O95183 116 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 OR6A2O95222 327 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ATP6V1G2O95670 118 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 NGFP01138 241 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 IGLV1-44P01699 117 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 HIST1H2ABP04908 130 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CD79AP11912 226 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 GRK5P34947 590 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MPV17P39210 176 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CAPZA2P47755 286 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 DAP3P51398 398 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SORDQ00796 357 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PSG4Q00888 419 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 GLO1Q04760 184 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SGCAQ16586 387 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 NCMAPQ5T1S8 102 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 AADACL4Q5VUY2 407 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 KRT80Q6KB66 452 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MTFR2Q6P444 385 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TMEM154Q6P9G4 183 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 Q6YL49 198 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TMEM200AQ86VY9 491 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CPOQ8IVL8 374 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 POMGNT2Q8NAT1 580 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CNIH3Q8TBE1 160 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 HSD17B8Q92506 261 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 HIST1H2ACQ93077 130 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 DTNBP1Q96EV8 351 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CYYR1Q96J86 154 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PITX2Q99697 317 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ARPC5LQ9BPX5 153 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TMEM204Q9BSN7 226 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 UBTD1Q9HAC8 227 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CMC2Q9NRP2 79 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 RASSF1Q9NS23 344 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TVP23BQ9NYZ1 205 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 USE1Q9NZ43 259 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 KIF17Q9P2E2 1029 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ZNF319Q9P2F9 582 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TACC2O95359 2948 aa4.76□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 H3BSH0 61 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ENTPD6O75354 484 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 WBP4O75554 376 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TUSC2O75896 110 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 KRT33AO76009 404 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 STAMBPO95630 424 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CLPTM1O96005 669 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 IGKV3-15P01624 115 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CD8AP01732 235 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SLC2A1P11166 492 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SELEP16581 610 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CDKN1AP38936 164 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 CENPAP49450 140 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ALDH3A2P51648 485 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 SMIM11AP58511 58 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 PRPS1P60891 318 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 NAAAQ02083 359 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 APOFQ13790 326 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 MST1LQ2TV78 715 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 ANKDD1AQ495B1 522 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 DMRTC1Q5HYR2 192 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 TIMM23BQ5SRD1 257 aa4.75□□□□□ -1.65
USP25-209ENST00000547201 C6orf52Q5T4I8 152 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.9 ms