RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528484.5

CMTM1-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CMTM1, Length 726 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM1-211ENST00000528484 GLB1L2Q8IW92 636 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 GJC3Q8NFK1 279 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 LINC01006Q8NI28 216 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SLC7A6Q92536 515 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TPD52L3Q96J77 140 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 PRRC1Q96M27 445 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 WDFY2Q96P53 400 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 FNDC11Q9BVV2 318 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 CDADC1Q9BWV3 514 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 HDHD2Q9H0R4 259 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.61□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 PRSS37A4D1T9 235 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 C5orf63A6NC05 138 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 NDUFA2O43678 99 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TSPAN15O95858 294 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV1-69P01742 117 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SFTPBP07988 381 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 CD14P08571 375 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 GATA4P43694 442 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 PROK1P58294 105 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TRAM2Q15035 370 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 OR8B8Q15620 311 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 FAM201AQ5SY85 155 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 DNM1P34Q6PK57 102 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF730Q6ZMV8 503 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 NRMQ8IXM6 262 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 Q8TCH9 128 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 LHX4Q969G2 390 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SLC22A4Q9H015 551 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.6□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 C22orf46C9J442 243 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 H0YL77 283 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 MLNRO43193 412 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 ADAM20O43506 726 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SLC16A7O60669 478 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 IGHV4-59P01825 116 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 SCG5P05408 212 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 DBHP09172 617 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 PSMB10P40306 273 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 CENPAP49450 140 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 OR8G1Q15617 311 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 CYBRD1Q53TN4 286 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 REC114Q7Z4M0 266 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 LDLRAD3Q86YD5 345 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 OR13C2Q8NGS9 318 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 C10orf82Q8WW14 230 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 TLCD1Q96CP7 247 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 COQ7Q99807 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 MRGBPQ9NV56 204 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 RNF7Q9UBF6 113 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 RAB21Q9UL25 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 AURKCQ9UQB9 309 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa9.59□□□□□ -0.87
CMTM1-211ENST00000528484 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 RER1O15258 196 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 PIN1P1O15428 100 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 FAM20BO75063 409 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ECDO95905 644 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 HLA-DPB1P04440 258 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 IFNW1P05000 195 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 FBP1P09467 338 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 CTLA4P16410 223 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 CD200P41217 278 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 CRYBA2P53672 197 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 PRKCDQ05655 676 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 MZT1Q08AG7 82 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 C11orf91Q3C1V1 193 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ZBED5Q49AG3 693 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 MESTQ5EB52 335 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 GPR139Q6DWJ6 353 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 NANOGP8Q6NSW7 305 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ZNF841Q6ZN19 808 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 Q6ZTK2 550 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 PGAP1Q75T13 922 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ADCK1Q86TW2 530 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 OFCC1Q8IZS5 231 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 GALNT4Q8N4A0 578 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 LRRC75AQ8NAA5 344 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 FAM156AQ8NDB6 213 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 OR8J3Q8NGG0 315 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 Q96M85 177 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 TBX15Q96SF7 602 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 SYT4Q9H2B2 425 aa9.58□□□□□ -0.88
CMTM1-211ENST00000528484 WDR76Q9H967 626 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms