RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 SNCBQ16143 134 aa11.55□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 LRRN1Q6UXK5 716 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ZNF101Q8IZC7 436 aa11.55□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RHOXF1Q8NHV9 184 aa11.55□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.54□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 HAO2Q9NYQ3 351 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PTTG3PQ9NZH4 202 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa11.54□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa11.54□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 H0YJX3 145 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 PHYHO14832 338 aa11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 NKPD1Q17RQ9 610 aa11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 SNX33Q8WV41 574 aa11.53□□□□□ -0.56
PGGT1B-204ENST00000503638 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.53□□□□□ -0.56
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PGGT1B-204ENST00000503638 KRT8P05787 483 aa11.52□□□□□ -0.57
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PGGT1B-204ENST00000503638 CDKN1AP38936 164 aa11.52□□□□□ -0.57
PGGT1B-204ENST00000503638 OPRL1P41146 370 aa11.52□□□□□ -0.57
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PGGT1B-204ENST00000503638 NAA40Q86UY6 237 aa11.52□□□□□ -0.57
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