RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489180.6

NPHP4-209, Transcript of nephrocystin 4, humanhuman

TSL 2

Gene NPHP4, Length 5,548 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4-209ENST00000489180 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 REEP6Q96HR9 211 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SIGLEC11Q96RL6 698 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 A0A096LPE4 126 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 A0A1W2PPZ6 126 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TBXA2RP21731 343 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 EGR3Q06889 387 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PBOV1Q9GZY1 135 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 V9GYS6 101 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ARRDC5A6NEK1 342 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 S100A7AQ86SG5 101 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 GPR119Q8TDV5 335 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 IAPPP10997 89 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 CD1EP15812 388 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 EXT1Q16394 746 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TMEM268Q5VZI3 342 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 FAM58AQ8N1B3 248 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR2AK2Q8NG84 335 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 IDSB3KWA1 339 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ADAM10O14672 748 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 JTBO76095 146 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 KIR2DS4P43632 304 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 B4GALNT1Q00973 533 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 KIR2DS1Q14954 304 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 AGBL4Q5VU57 503 aa15.99■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 CHRNB4P30926 498 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SLC17A1Q14916 467 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TAF9Q16594 264 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ZNF626Q68DY1 528 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR4C16Q8NGL9 310 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 R4GMQ9 66 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 A0A1B0GUH1 482 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 M0R135 149 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 DEFA4P12838 97 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ZNF85Q03923 595 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 LAIR1Q6GTX8 287 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ANKRD53Q8N9V6 530 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ZNF799Q96GE5 643 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TAAR5O14804 337 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SLC23A1Q9UHI7 598 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 LRP3O75074 770 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 WDR1O75083 606 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 EPXP11678 715 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 GSK3AP49840 483 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 HES1Q14469 280 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR8G1Q15617 311 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 AANATQ16613 207 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 C4orf17Q53FE4 359 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 THEM4Q5T1C6 240 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 RTL8AQ9BWD3 113 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 MAGT1Q9H0U3 335 aa15.98■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 F6UZH7 168 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR2J2O76002 312 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PPICP45877 212 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PCK2Q16822 640 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 LINC00303Q3SY05 128 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR4F5Q8NH21 305 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OR4F4Q96R69 305 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 MED18Q9BUE0 208 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 C5orf49A4QMS7 147 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 NKX6-3A6NJ46 265 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 ADRA2CP18825 462 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 GZMKP49863 264 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 TPBGQ13641 420 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 KIRREL2Q6UWL6 708 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 DEFB127Q9H1M4 99 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 S1PR5Q9H228 398 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PPP5D1E7EU14 171 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 SELENBP1Q13228 472 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 INSL4Q14641 139 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PLAC9Q5JTB6 97 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PHYHD1Q5SRE7 291 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 APH1BQ8WW43 257 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 C10orf90Q96M02 699 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 OBP2AQ9NY56 170 aa15.97■□□□□ 0.15
NPHP4-209ENST00000489180 PPM1DO15297 605 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.5 ms