RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486357.1

APOBEC3G-206, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

TSL 4

Gene APOBEC3G, Length 543 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-206ENST00000486357 A8MVM7 634 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 J3QLI3 93 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 M0R3G1 203 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST8SIA3O43173 380 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RIPK2O43353 540 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 AHSA1O95433 338 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB36O95755 333 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 FGF4P08620 206 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUDT17P0C025 328 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 GKN3PP0CG01 181 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 UQCRC2P22695 453 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 GABRA5P31644 462 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 GLRXP35754 106 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CCL8P80075 99 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 BAMBIQ13145 260 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MELKQ14680 651 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 UGT3A2Q3SY77 523 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 C1orf140Q5VVS0 124 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF165Q6ZSG1 346 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 KCTD9Q7L273 389 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 LRP11Q86VZ4 500 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF440Q8IYI8 595 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANKFN1Q8N957 763 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MIPOL1Q8TD10 442 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 TIMD4Q96H15 378 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 C3orf30Q96M34 536 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MED29Q9NX70 200 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 UBAP1Q9NZ09 502 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 TAAR3PQ9P1P4 343 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 BLOC1S6Q9UL45 172 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 POFUT2Q9Y2G5 429 aa6□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 DBX1A6NMT0 343 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 GUSBP08236 651 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 TFPTP0C1Z6 253 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 PNMTP11086 282 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 PRTN3P24158 256 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAGEB1P43366 347 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPS5P46782 204 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 AQP5P55064 265 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CDH12P55289 794 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 NME5P56597 212 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLDN8P56748 225 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 LCN2P80188 198 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 FUT5Q11128 374 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXE3Q13461 319 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CHI3L2Q15782 390 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 SYPL1Q16563 259 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ARMCX4Q5H9R4 360 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ANXA8L1Q5VT79 327 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 WBP2NLQ6ICG8 309 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RNF130Q86XS8 419 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 FOXRED2Q8IWF2 684 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RIMKLAQ8IXN7 391 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 C4orf33Q8N1A6 199 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ICA1LQ8NDH6 482 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ST7LQ8TDW4 575 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAB1CQ92928 201 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC25A28Q96A46 364 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 PPP1R36Q96LQ0 422 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 OXGR1Q96P68 337 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 GAL3ST1Q99999 423 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 SLC35A5Q9BS91 424 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 OR51B6Q9H340 312 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RAD21L1Q9H4I0 556 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 IL19Q9UHD0 177 aa5.99□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 A0A1W2PPQ1 181 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 CLDN25C9JDP6 229 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 HMGN4O00479 90 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 FAAHO00519 579 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 SELENOFO60613 162 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 RP2O75695 350 aa5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
APOBEC3G-206ENST00000486357 B4GALT1P15291 398 aa5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms