RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475470.1

RPUSD3-215, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 3, human

TSL 2

Gene RPUSD3, Length 2,413 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPUSD3-215	ENST00000475470	DYRK1A	Q13627	763 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	KLF9	Q13886	244 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SF3B4	Q15427	424 aa	Known RBP eCLIP	13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ADGRG7	Q96K78	797 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	DIABLO	Q9NR28	239 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FLVCR1	Q9Y5Y0	555 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	XRCC3	O43542	346 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GIF	P27352	417 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	EFNB2	P52799	333 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GALK2	Q01415	458 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ANKRD16	Q6P6B7	361 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SULF2	Q8IWU5	870 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC7A6	Q92536	515 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	HES7	Q9BYE0	225 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	LINC01387	J3KSC0	135 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CTAG2	O75638	210 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TPPP	O94811	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	MT-ND4	P03905	459 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	PTHLH	P12272	177 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ARSB	P15848	533 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	KCNK15	Q9H427	330 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ACOT7	O00154	380 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CLDN15	P56746	228 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	AP3S2	P59780	193 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	BTG1	P62324	171 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR8B12	Q8NGG6	310 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CPNE4	Q96A23	557 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ST6GAL2	Q96JF0	529 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF703	Q9H7S9	590 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	NUDT15	Q9NV35	164 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	COPZ2	Q9P299	210 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	RCE1	Q9Y256	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GGT3P	A6NGU5	568 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF716	A6NP11	495 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TCRB	P04435	133 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CD37	P11049	281 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	BDKRB2	P30411	391 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	AAED1	Q7RTV5	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SLC5A6	Q9Y289	635 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470		A0A1B0GTI1	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	DHFR	P00374	187 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF20	P17024	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	FAM166B	A8MTA8	275 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	HPN	P05981	417 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CCR6	P51684	374 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TGIF1	Q15583	401 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TTTY12	Q9BZ98	90 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	GPR84	Q9NQS5	396 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	LRP3	O75074	770 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CELA3A	P09093	270 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	RAB3A	P20336	220 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPUSD3-215	ENST00000475470	CD82	P27701	267 aa		13.54	□□□□□ -0.24

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