RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378778.5

PTPRR-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-203ENST00000378778 AVPR2P30518 371 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PDGFRLQ15198 375 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ASPHD2Q6ICH7 369 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 KCTD9Q7L273 389 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 C10orf53Q8N6V4 93 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 POC1AQ8NBT0 407 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 OR13C3Q8NGS6 347 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 OR52N5Q8NH56 324 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SGK3Q96BR1 496 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RAB3CQ96E17 227 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 LAT2Q9GZY6 243 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HRH4Q9H3N8 390 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SLC5A6Q9Y289 635 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TMEM235A6NFC5 223 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 NPIPB13A6NJU9 1138 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 NPIPB4C9JG80 1138 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 H0YGG7 62 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 NFYBP25208 207 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HTR5AP47898 357 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PRSS12P56730 875 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TAS2R46P59540 309 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RPL27P61353 136 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 QRFPP83859 136 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HGFACQ04756 655 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SKP2Q13309 424 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 CST6Q15828 149 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SGCBQ16585 318 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PCK2Q16822 640 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 DHRS11Q6UWP2 260 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 BCORP1Q8N888 145 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF519Q8TB69 540 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZDHHC12Q96GR4 267 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 APOOQ9BUR5 198 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 FBRSQ9HAH7 460 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 DZANK1Q9NVP4 752 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 GDE1Q9NZC3 331 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TCFL5Q9UL49 500 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PRSS37A4D1T9 235 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 A6NIZ1 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 FAM171A2A8MVW0 826 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 H0YIZ8 118 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 BGLAPP02818 100 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HOXB5P09067 269 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HOXA5P20719 270 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 LPAR6P43657 344 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RAP1BP61224 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RAP1AP62834 184 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 FUT7Q11130 342 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 OR7A5Q15622 319 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 GAB4Q2WGN9 574 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RHOUQ7L0Q8 258 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZFP82Q8N141 532 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 OR56B1Q8NGI3 324 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 OR4K15Q8NH41 348 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 CASTOR1Q8WTX7 329 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 C5orf34Q96MH7 638 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 CLCC1Q96S66 551 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TOLLIPQ9H0E2 274 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TXNIPQ9H3M7 391 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 LUZP4Q9P127 313 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 GHRLQ9UBU3 117 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TMEM184BQ9Y519 407 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SCN3AQ9NY46 2000 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 A0A0J9YY10 115 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 DCTN6O00399 190 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF217O75362 1048 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 IL33O95760 270 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 TSPAN15O95858 294 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 AKR1C4P17516 323 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 HRH1P35367 487 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 SNCAP37840 140 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 PPT1P50897 306 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ACTR1AP61163 376 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ID2Q02363 134 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF117Q03924 483 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 ZNF529Q6P280 563 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRR-203ENST00000378778 NPSR1Q6W5P4 371 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms