RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-DOBP13765 273 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TGM4P49221 684 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FOXF1Q12946 379 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 YIPF6Q96EC8 236 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TIMD4Q96H15 378 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF225Q9UK10 706 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 IMPA2O14732 288 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PIAS2O75928 621 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TNFSF15O95150 251 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TESK1Q15569 626 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CATSPERDQ86XM0 798 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 A0A087WUJ7 227 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TXNL1O43396 289 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CLN5O75503 358 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PDGFAP04085 211 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TAF9Q16594 264 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR8G2PQ6IF36 304 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SMIM15Q7Z3B0 74 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 BATF2Q8N1L9 274 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NTN4Q9HB63 628 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 IL20Q9NYY1 176 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GLI3P10071 1580 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NKX2-2O95096 273 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RPS2P15880 293 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ADRA2CP18825 462 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HYAL1Q12794 435 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CADM4Q8NFZ8 388 aa18.36■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 A0A096LPE4 126 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1W2PPZ6 126 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2F2O95006 317 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PSMB3P49720 205 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2F1Q13607 317 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HES1Q14469 280 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ARHGDIGQ99819 225 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PLK3Q9H4B4 646 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SPTA1P02549 2419 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR8U8P0C7N1 319 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RAB5CP51148 216 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ALG14Q96F25 216 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF385DQ9H6B1 395 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 A4GNTQ9UNA3 340 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 WDR1O75083 606 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-HP01893 362 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SOX18P35713 384 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0040Q15053 153 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TAF9BQ9HBM6 251 aa18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2W5A6NFC9 320 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ANKUB1A6NFN9 424 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR10A3P58181 314 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 CISD3P0C7P0 127 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GLI4P10075 376 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 GSK3AP49840 483 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2G3Q8NGZ4 309 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 NUDT9Q9BW91 350 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 KIR2DL3P43628 341 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HLA-BQ31612 363 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TERB2Q8NHR7 220 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 MRGPRX3Q96LB0 322 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TRIB1Q96RU8 372 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 PIGMQ9H3S5 423 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SERGEFQ9UGK8 458 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TAAR5O14804 337 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OPRM1P35372 400 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF85Q03923 595 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SFT2D1Q8WV19 159 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 KCNE3Q9Y6H6 103 aa18.34■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 MEIKINA0A087WXM9 373 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF683Q8IZ20 524 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 REEP6Q96HR9 211 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 MKRN2OSH3BPM6 223 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 JTBO76095 146 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 DEFA4P12838 97 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF626Q68DY1 528 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 OR2V1Q8NHB1 315 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 WBP1LQ9NX94 342 aa18.33■□□□□ 0.53
CCSAP-203ENST00000366687 SCN7AQ01118 1682 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-203ENST00000366687 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-203ENST00000366687 TSTD3H0UI37 97 aa18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-203ENST00000366687 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CCSAP-203ENST00000366687 BHLHE40O14503 412 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms