RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225983.10

HDAC5-201, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene HDAC5, Length 5,326 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-201ENST00000225983 OR10J5Q8NHC4 309 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 KCNJ15Q99712 375 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ABCA3Q99758 1704 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TPOP07202 933 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 CRYBB2P43320 205 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RNF165Q6ZSG1 346 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR4C3Q8NH37 302 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SEH1LQ96EE3 360 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 MRGPRX4Q96LA9 322 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 PTHLHP12272 177 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR4C16Q8NGL9 310 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 APH1BQ8WW43 257 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 C3orf49Q96BT1 292 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 BARHL1Q9BZE3 327 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NEU3Q9UQ49 428 aa14.62□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 C5orf49A4QMS7 147 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR5H14A6NHG9 310 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 DUSP2Q05923 314 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 HYAL1Q12794 435 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 B3GAT1Q9P2W7 334 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TMED6Q8WW62 240 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 WDR34Q96EX3 536 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 PLK3Q9H4B4 646 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 GPANK1O95872 356 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TIGD3Q6B0B8 471 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR2G3Q8NGZ4 309 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SMIM4Q8WVI0 70 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 LINC00303Q3SY05 128 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 REEP6Q96HR9 211 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SAMD10Q9BYL1 202 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.61□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 A0A1B0GUH1 482 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZFP92A6NM28 416 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 METTL12A8MUP2 240 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 HOXC8P31273 242 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 HMGN3Q15651 99 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RDH5Q92781 318 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 UFSP2Q9NUQ7 469 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 CACNA1CQ13936 2221 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ST8SIA3O43173 380 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NME2P1O60361 137 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NKX2-2O95096 273 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NRASP01111 189 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NFYBP25208 207 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TCTN1Q2MV58 587 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SFT2D1Q8WV19 159 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF416Q9BWM5 594 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 SERTM1A2A2V5 107 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TBX19O60806 448 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 B4GALT1P15291 398 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 GZMKP49863 264 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 RAB5CP51148 216 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 LMO7DNF2Z398 122 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 PCMT1P22061 227 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 KIR2DS4P43632 304 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ELLP55199 621 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 KIR2DS1Q14954 304 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 H3F3CQ6NXT2 135 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TMEM71Q6P5X7 295 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 NLRC3Q7RTR2 1065 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR2AK2Q8NG84 335 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR13C8Q8NGS7 320 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa14.6□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR2F2O95006 317 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 HPNP05981 417 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ATF1P18846 271 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 TGM1P22735 817 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 OR2F1Q13607 317 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 AVPI1Q5T686 147 aa14.59□□□□□ -0.07
HDAC5-201ENST00000225983 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms