RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Esp1Q3LHH8 102 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Yy2Q3TTC2 378 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MeikinQ5F2C3 434 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nol4lQ6DIB4 494 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr135Q7TQP2 457 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr406Q7TRX0 323 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clvs2Q8BG92 327 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 BlvrbQ923D2 206 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Samd8Q9DA37 478 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Wwtr1Q9EPK5 395 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc37a2Q9WU81 501 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Phf1Q9Z1B8 559 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ArsaP50428 506 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sox3P53784 375 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 S100a1P56565 94 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf385bQ8BXJ8 482 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc35b4Q8CIA5 331 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr51Q8VGG9 307 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gorasp1Q91X51 446 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hspb2Q99PR8 182 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnaseh2cQ9CQ18 166 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf346Q9R0B7 294 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r61W4VSP5 300 aa10.01□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Igkv12-46A0A140T8P6 115 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr110A2RT31 317 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930522L14RikE9QAG4 666 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cnih2O35089 160 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Klk1b8P07628 261 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdx2P43241 311 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps18P62270 152 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nxt2Q3UNA4 142 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zdhhc8Q5Y5T5 762 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf629Q6A085 867 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr111Q7TRK1 317 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r201Q8R262 300 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lims2Q91XD2 341 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LhppQ9D7I5 270 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nudt22Q9DD16 308 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnip2Q9JJ69 270 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 D17h6s53eQ9Z1R4 293 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tnfrsf14A0A1W2P7D5 276 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm14418A2ARR6 358 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm14322A2AW66 358 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr209L7N1X3 305 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sap25Q1EHW4 186 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnase12Q5GAM8 145 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr10Q60883 311 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp874aQ8BX23 447 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Q8C3I9 435 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930451G09RikQ8C5G4 195 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pqlc3Q8C6U2 202 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1443Q8VFW8 312 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cts7Q91ZF2 331 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ceacam13Q9DAT7 263 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clec4dQ9Z2H6 219 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Obp2bA2BHR0 176 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ceacam19Q3TQ88 271 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SetmarQ80UJ9 309 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tor2aQ8R1J9 321 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ntmt1Q8R2U4 223 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ing5Q9D8Y8 240 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem9bQ9JJR8 199 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mmp17Q9R0S3 578 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 AireQ9Z0E3 552 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Htra4A2RT60 483 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem229aB9EJI9 371 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ighg2cF6TQW2 404 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P01864 335 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SftpcP21841 193 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tacr1P30548 407 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mfap2P55002 183 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ctxn2Q3URE8 81 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam122bQ6NZE7 255 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 TiparpQ8C1B2 657 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc24a4Q8CGQ8 622 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mmd2Q8R189 247 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CdiptQ8VDP6 213 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ppp1r14aQ91VC7 147 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Exosc8Q9D753 276 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hnf4gQ9WUU6 408 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm4950D3YUM8 205 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sh2b3O09039 548 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P06335 190 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bpifa2P07743 235 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cox5bP19536 128 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rab22aP35285 194 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rac1P63001 192 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Crmp1P97427 572 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adam4Q8CGQ2 763 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn1r8Q8R2C2 303 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Utp23Q9CX11 249 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acp1Q9D358 158 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ms4a4bQ9ES61 226 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nkain4Q9JMG4 208 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PlpbpQ9Z2Y8 274 aa10□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ces2gE9PV38 560 aa9.99□□□□□ -0.81
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PipP02816 146 aa9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms