RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.71□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 BLACEA4D250 179 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HTR3EA5X5Y0 456 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 SCGB1D2O95969 90 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 IGLV3-19P01714 112 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 PMP2P02689 132 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 HPXP02790 462 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 BGLAPP02818 100 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 OR52N5Q8NH56 324 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 CLPSP04118 112 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 Q6ZTK2 550 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 C4orf45Q96LM5 186 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 OR8B4Q96RC9 309 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 TRAM1Q15629 374 aa6.7□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 RNF144BQ7Z419 303 aa6.7□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 HMX3A6NHT5 357 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 ZNF208O43345 1280 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 ABCA1O95477 2261 aa6.69□□□□□ -1.34
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PKP4-217ENST00000628904 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 GPRIN2O60269 458 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 MT-ATP6P00846 226 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CELA3AP09093 270 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ANXA3P12429 323 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 CASRP41180 1078 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-217ENST00000628904 ARHGDIBP52566 201 aa6.69□□□□□ -1.34
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