RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616135.1

MMACHC-203, Transcript of methylmalonic aciduria (cobalamin deficiency) cblC type, with homocystinuria, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MMACHC, Length 1,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHC-203ENST00000616135 PCK2Q16822 640 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 TEX30Q5JUR7 227 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 KRT80Q6KB66 452 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CFAP77Q6ZQR2 320 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CDC20BQ86Y33 519 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CCDC36Q8IYA8 594 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SGCDQ92629 289 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF75AQ96N20 296 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ABHD6Q9BV23 337 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR10A4Q9H209 315 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 Q9H521 79 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CENPMQ9NSP4 180 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ICE1Q9Y2F5 2266 aa6.36□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LOC100509620A0A075B734 347 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DPRXA6NFQ7 191 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SNTNA6NMZ2 147 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 VGLL3A8MV65 326 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PRR32B1ATL7 298 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 J3QRE1 110 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CASKO14936 926 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SGCEO43556 437 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DBHP09172 617 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 IGFBP2P18065 325 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ALOX5APP20292 161 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CCNOP22674 350 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SLC15A1P46059 708 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CXCR4P61073 352 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PCBD1P61457 104 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SCRN3Q0VDG4 424 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 TMED1Q13445 227 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 MED21Q13503 144 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 KLHL22Q53GT1 634 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 VHLLQ6RSH7 139 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SSX6Q7RTT6 188 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF786Q8N393 782 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF540Q8NDQ6 660 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 GJC3Q8NFK1 279 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR52I1Q8NGK6 324 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OTOSQ8NHW6 89 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ST7LQ8TDW4 575 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SLAMF6Q96DU3 332 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DACH2Q96NX9 599 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 C1orf198Q9H425 327 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OBP2BQ9NPH6 170 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LAMP5Q9UJQ1 280 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 F5H5K5 113 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SLC1A7O00341 560 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SYNGR3O43761 229 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DOK2O60496 412 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 IGKV3-15P01624 115 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 IGLV1-44P01699 117 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SERPINA5P05154 406 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LYNP07948 512 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 OR2T7P0C7T2 308 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CECR9P0C854 216 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CRYGSP22914 178 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 STOMP27105 288 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 CALCRP30988 508 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 HTR5AP47898 357 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 GALK2Q01415 458 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ZNF85Q03923 595 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 PLP2Q04941 152 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 SPOCK1Q08629 439 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ST3GAL4Q11206 333 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 RAB40BQ12829 278 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 XP32Q5T750 250 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 LRRN1Q6UXK5 716 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 AHSA2Q719I0 299 aa6.35□□□□□ -1.39
MMACHC-203ENST00000616135 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms