RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 MAGEB1P43366 347 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP5CP53041 499 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PCBD1P61457 104 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ECH1Q13011 328 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RAB35Q15286 201 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 P4HA3Q7Z4N8 544 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 LRRC18Q8N456 261 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 WNT2BQ93097 391 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SLITRK2Q9H156 845 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MIXL1Q9H2W2 232 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa19.99■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTBN2O15020 2390 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 APOC1P02654 83 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TTRP02766 147 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OR3A2P47893 321 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SOX2P48431 317 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OR10A3P58181 314 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP3R1P63098 170 aa19.98■□□□□ 0.79
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CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF100Q8IYN0 542 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OR51A4Q8NGJ6 313 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ASB5Q8WWX0 329 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GPR137Q96N19 417 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SH3GL3Q99963 347 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 HDHD2Q9H0R4 259 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ABCB9Q9NP78 766 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TTLL8A6PVC2 850 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 J3QRK9 145 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 FARS2O95363 451 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ACSM4P0C7M7 580 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 EPXP11678 715 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 B4GALT1P15291 398 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CX3CR1P49238 355 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ARF1P84077 181 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 STAC2Q6ZMT1 411 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF813Q6ZN06 617 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SKA3Q8IX90 412 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TMEM106AQ96A25 262 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CEP19Q96LK0 163 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 GFI1Q99684 422 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC30A2Q9BRI3 323 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 UPB1Q9UBR1 384 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 FOXJ3Q9UPW0 622 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 DHDHQ9UQ10 334 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RAXQ9Y2V3 346 aa19.97■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 OR6C6A6NF89 314 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SGCEO43556 437 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNGR3O43761 229 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 FSTP19883 344 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 CRYGSP22914 178 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 PRKXP51817 358 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP19.96■□□□□ 0.792e-10■■■■■ 40.3
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CAPNS1-207ENST00000589146 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 KRTCAP3Q53RY4 240 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SPANXN2Q5MJ10 180 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 IDNKQ5T6J7 187 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 LAX1Q8IWV1 398 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIB1Q96RU8 372 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 TCF7L1Q9HCS4 588 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC17A5Q9NRA2 495 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 ABRACLQ9P1F3 81 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 MALT1Q9UDY8 824 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC5A6Q9Y289 635 aa19.96■□□□□ 0.79
CAPNS1-207ENST00000589146 RGS5O15539 181 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 IGHV3-9P01782 118 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CD2P06729 351 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CD37P11049 281 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF32P17041 273 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL1P22362 96 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ID4P47928 161 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD7P51665 324 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 FBXW9Q5XUX1 488 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC16A14Q7RTX9 510 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PARP16Q8N5Y8 322 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF283Q8N7M2 679 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR1F12Q8NHA8 337 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 EXTL1Q92935 676 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 SPTSSAQ969W0 71 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ORAI1Q96D31 301 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 OR2H1Q9GZK4 316 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 PLEK2Q9NYT0 353 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 ATPIF1Q9UII2 106 aa19.95■□□□□ 0.78
CAPNS1-207ENST00000589146 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
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