RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 DBHP09172 617 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4A8P0C604 315 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 HTR1FP30939 366 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 SERPINF1P36955 418 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 MEDAGQ5VYS4 303 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TTC23Q5W5X9 447 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1orf174Q8IYL3 243 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENTHD1Q8IYW4 607 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF454Q8N9F8 522 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 NRG4Q8WWG1 115 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD6Q9BV23 337 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 YIPF3Q9GZM5 350 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa28.53■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 DHRSXQ8N5I4 330 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOL4Q9BPW4 351 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 TBCCD1Q9NVR7 557 aa28.52■■■□□ 2.16
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF878C9JN71 531 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V1G2O95670 118 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD8AP01732 235 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 LCKP06239 509 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 GABRB1P18505 474 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMED1Q13445 227 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 OCLNQ16625 522 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOUQ7L0Q8 258 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1J1Q8NGS3 322 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYGBQ8WWM9 190 aa28.51■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 LYNP07948 512 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 EFNB3Q15768 340 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ABHD4Q8TB40 342 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MBD6Q96DN6 1003 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 COPS4Q9BT78 406 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CXorf56Q9H5V9 222 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CENPMQ9NSP4 180 aa28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS6P49758 472 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 NUDT6P53370 316 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU4F2Q12837 409 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf71Q6IPW1 123 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOXF1Q8NHV9 184 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF133Q8WVZ7 376 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPTSSAQ969W0 71 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADI1Q9BV57 179 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 PLK3Q9H4B4 646 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADGRL4Q9HBW9 690 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 LAMP5Q9UJQ1 280 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC168Q8NDH2 2452 aa28.49■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 B9A039 149 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 F5H5K5 113 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 J3QW42 95 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 NGFP01138 241 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC15A1P46059 708 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ERVS71-1P61550 626 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 THEM6Q8WUY1 208 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 VCX3BQ9H321 246 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNTNA6NMZ2 147 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ENTPD6O75354 484 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ALOX5APP20292 161 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TPTEP56180 551 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF13Q15543 124 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MSMPQ1L6U9 139 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SWI5Q1ZZU3 235 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MST1LQ2TV78 715 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF691Q5VV52 312 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR51G2Q8NGK0 314 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 AMELYQ99218 206 aa28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YAE9 185 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 M0R135 149 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOL3O00110 214 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 SBK2P0C263 348 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ACSM4P0C7M7 580 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 GRB2P62993 217 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 DEFB113Q30KQ7 82 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF799Q96GE5 643 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q96MT0 163 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 COG8Q96MW5 612 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MNTQ99583 582 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNJ15Q99712 375 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa28.47■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX15Q9BXT5 2789 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 H0YJX3 145 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMP4P12644 408 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF250P15622 560 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 TUBG1P23258 451 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPGP40121 348 aa28.46■■■□□ 2.15
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVX1P49640 407 aa28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms