RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, human

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMOD3-208	ENST00000560725	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RASL10A	Q92737	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	C8orf44	Q96CB5	159 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	GNB4	Q9HAV0	340 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	TAC3	Q9UHF0	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
TMOD3-208	ENST00000560725	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FLNC	Q14315	2725 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC19A2	O60779	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NIPSNAP2	O75323	286 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KBTBD11	O94819	623 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CT45A10	P0DMU9	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PGC	P20142	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HTR1E	P28566	365 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ACVR1B	P36896	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MAGEA6	P43360	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RIPPLY3	P57055	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CRADD	P78560	199 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	IL18R1	Q13478	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TMEM225	Q6GV28	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CYHR1	Q6ZMK1	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725		Q6ZPB1	254 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PRELID2	Q8N945	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TM4SF19	Q96DZ7	209 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PRAP1	Q96NZ9	151 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CCT7	Q99832	543 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RPH3AL	Q9UNE2	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CREBBP	Q92793	2442 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GOLGA8K	D6RF30	607 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GOLGA8T	H3BQL2	631 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HAT1	O14929	419 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FGG	P02679	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	C8G	P07360	202 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	UQCRC2	P22695	453 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	XCR1	P46094	333 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ALDH3B2	P48448	385 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	CSNK1G2	P78368	415 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PUDP	Q08623	228 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RIPK1	Q13546	671 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NSDHL	Q15738	373 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ACSM5	Q6NUN0	579 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MDS2	Q8NDY4	140 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	C7orf34	Q96L11	122 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TRIM45	Q9H8W5	580 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PARVB	Q9HBI1	364 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	PRODH2	Q9UF12	536 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	MEMO1	Q9Y316	297 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	COL12A1	Q99715	3063 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	EFNA2	O43921	213 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TTC4	O95801	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	TSPAN12	O95859	305 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	F10	P00742	488 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	KRT14	P02533	472 aa		4.56	□□□□□ -1.68
TMOD3-208	ENST00000560725	H2BFM	P0C1H6	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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