RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519068.2

MSC-AS1-205, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 569 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-205ENST00000519068 DCTN6O00399 190 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 DENRO43583 198 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ENTPD6O75354 484 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TNFSF13O75888 250 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPANK1O95872 356 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RENP00797 406 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IFNGP01579 166 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGHG1P01857 330 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGHMP01871 453 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GYPBP06028 91 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGA4P0DJD7 388 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PGA3P0DJD8 388 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLUP10909 449 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FCGR2AP12318 317 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PYCR1P32322 319 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR3A2P47893 321 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MTNR1AP48039 350 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CSNK1A1P48729 337 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PCYT1AP49585 367 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HCCSP53701 268 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IL5RAQ01344 420 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CD47Q08722 323 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KEAP1Q14145 624 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CRMP1Q14194 572 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SGCAQ16586 387 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HIST3H3Q16695 136 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KLHL12Q53G59 568 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MESTQ5EB52 335 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 C9orf135Q5VTT2 229 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF691Q5VV52 312 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OTPQ5XKR4 325 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LINGO2Q7L985 606 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IZUMO1Q8IYV9 350 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM123Q8N131 208 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 GPR137CQ8N3F9 429 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SDR9C7Q8NEX9 313 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 BBS1Q8NFJ9 593 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR8J1Q8NGP2 316 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF519Q8TB69 540 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM163Q8TC26 289 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TMEM45BQ96B21 275 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 APH1AQ96BI3 265 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 LRR1Q96L50 414 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CNBD2Q96M20 576 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FOXN4Q96NZ1 517 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TEAD3Q99594 435 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 APOL4Q9BPW4 351 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FN3KQ9H479 309 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CMC2Q9NRP2 79 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CLN6Q9NWW5 311 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ASB6Q9NWX5 421 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IMPAD1Q9NX62 359 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UBAP1Q9NZ09 502 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PEMTQ9UBM1 199 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 UPB1Q9UBR1 384 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 HSPB7Q9UBY9 170 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FBXL17Q9UF56 701 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 RAB26Q9ULW5 256 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PROCRQ9UNN8 238 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.69□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZZEF1O43149 2961 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 FREM1Q5H8C1 2179 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SHANK1Q9Y566 2161 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 CACNA1CQ13936 2221 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 BSNQ9UPA5 3926 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 SH3D21A4FU49 640 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 TVP23AA6NH52 213 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPIPB5A8MRT5 1133 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 NPIPB4C9JG80 1138 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 MPZL2O60487 215 aa4.68□□□□□ -1.66
MSC-AS1-205ENST00000519068 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms