RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504543.1

USP17L28-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 17-like family member 28, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene USP17L28, Length 1,593 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L28-201ENST00000504543 THEM6Q8WUY1 208 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 NSMAFQ92636 917 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 DERL3Q96Q80 235 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OR14A2Q96R54 314 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 AMELYQ99218 206 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ABCB9Q9NP78 766 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PTPN13Q12923 2485 aa9□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 A0A0J9YW62 118 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 NOTOA8MTQ0 251 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PDCD5O14737 125 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RAF1P04049 648 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 LAP3P28838 519 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OPRM1P35372 400 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 THBS2P35442 1172 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CLDN20P56880 219 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PMPCAQ10713 525 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ZNF79Q15937 498 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 KCNMB1Q16558 191 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 C10orf128Q5T292 105 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FAM27D1Q5T7N8 215 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RHOUQ7L0Q8 258 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 MRGPRGQ86SM5 289 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 GDPD1Q8N9F7 314 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OR9K2Q8NGE7 335 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ST7LQ8TDW4 575 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 HSD17B8Q92506 261 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 MS4A3Q96HJ5 214 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ABHD6Q9BV23 337 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SRRQ9GZT4 340 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SP140LQ9H930 580 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RNF122Q9H9V4 155 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ELOVL3Q9HB03 270 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FRRS1LQ9P0K9 344 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 DAPK2Q9UIK4 370 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SLC22A20A6NK97 555 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ZNF726A6NNF4 738 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PSMD9O00233 223 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 GPR171O14626 319 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ZNHIT1O43257 154 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 TBX1O43435 398 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ZG16O60844 167 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RAMP1O60894 148 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 NCR1O76036 304 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 TOXO94900 526 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CLDN14O95500 239 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PTTG1O95997 202 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OPN1LWP04000 364 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CTSSP25774 331 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 DCTDP32321 178 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CAV3P56539 151 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CARD18P57730 90 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CAMK2DQ13557 499 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 GUSBP1Q15486 140 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 STEAP3Q658P3 488 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 LRRN1Q6UXK5 716 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CREB3L2Q70SY1 520 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 KRT77Q7Z794 578 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 MED12LQ86YW9 2145 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 PRSS35Q8N3Z0 413 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ACBD4Q8NC06 268 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 OR10D3Q8NH80 312 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SETD6Q8TBK2 473 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RNF133Q8WVZ7 376 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 COX4I2Q96KJ9 171 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 TRIB1Q96RU8 372 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SOSTQ9BQB4 213 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 MRI1Q9BV20 369 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 EMC6Q9BV81 110 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FAIMQ9NVQ4 179 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ABRACLQ9P1F3 81 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 RCE1Q9Y256 329 aa8.99□□□□□ -0.97
USP17L28-201ENST00000504543 LRP12Q9Y561 859 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms