RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 LRRC75AQ8NAA5 344 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CYB561A3Q8NBI2 242 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ENKURQ8TC29 256 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 PGLYRP3Q96LB9 341 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TBX5Q99593 518 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 NPAS1Q99742 590 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 KLHDC3Q9BQ90 382 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ALG12Q9BV10 488 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CALHM2Q9HA72 323 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 C14orf119Q9NWQ9 140 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 GRHPRQ9UBQ7 328 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TBC1D24Q9ULP9 559 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 VDAC3Q9Y277 283 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ARID1AO14497 2285 aa5.54□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TEX13CA0A0J9YWL9 993 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PQ09 198 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 A6NNC1 897 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 A8MVM7 634 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 XKRYO14609 159 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CSF3P09919 207 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CLUP10909 449 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 IMPDH2P12268 514 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CPN1P15169 458 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 RAB3BP20337 219 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 NPR2P20594 1047 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 EDNRAP25101 427 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 APEX1P27695 318 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 OPRM1P35372 400 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 GDI2P50395 445 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CLDN15P56746 228 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CLDN20P56880 219 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 OR2B6P58173 313 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 OR12D2P58182 307 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ERVK-25P63136 954 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 PITPNAQ00169 270 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZNF117Q03924 483 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 EGR3Q06889 387 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 SLC3A1Q07837 685 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 C17orf67Q0P5P2 114 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 IL18Q14116 193 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TESK1Q15569 626 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TAB1Q15750 504 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 SGCBQ16585 318 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 BAK1Q16611 211 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 NDUFAF6Q330K2 333 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 IDNKQ5T6J7 187 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 FAM69AQ5T7M9 428 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 PYHIN1Q6K0P9 492 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ALKBH2Q6NS38 261 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 SFXN4Q6P4A7 337 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 VWA1Q6PCB0 445 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 FAM122BQ7Z309 247 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CDC20BQ86Y33 519 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 Q8N402 240 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 FADS6Q8N9I5 356 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 SCAIQ8N9R8 606 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 IL17RDQ8NFM7 739 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 OR6K6Q8NGW6 343 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 RNF138Q8WVD3 245 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ST8SIA1Q92185 356 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 GHSRQ92847 366 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 KLHL15Q96M94 604 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 NMNAT3Q96T66 252 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 TIGARQ9NQ88 270 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CYSLTR2Q9NS75 346 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 FKBP7Q9Y680 259 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 ZANQ9Y493 2812 aa5.53□□□□□ -1.52
MITF-215ENST00000478490 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 A0A1W2PNV4 684 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 OR2M5A3KFT3 312 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 OR6C68A6NDL8 312 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TUBAL3A6NHL2 446 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 SLC22A20A6NK97 555 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 CENPBD1B2RD01 187 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 HPGDSO60760 199 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 TPPPO94811 219 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 OR6A2O95222 327 aa5.52□□□□□ -1.53
MITF-215ENST00000478490 AHSA1O95433 338 aa5.52□□□□□ -1.53
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