RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF681Q96N22 645 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF599Q96NL3 588 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SERPINB11Q96P15 392 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 HDHD2Q9H0R4 259 aa4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0J9YXY3 114 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 F8VP50 259 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BNH8 94 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8RI6L899 631 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 B4GALT5O43286 388 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC16A7O60669 478 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 BRI3O95415 125 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 IGKV3-20P01619 116 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TCP1P17987 556 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MAS1LP35410 378 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UGT2B10P36537 528 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 P2RY2P41231 377 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 MEOX2P50222 304 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 AP1S2P56377 157 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 REG3AQ06141 175 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 C2orf80Q0P641 193 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PAGE3Q5JUK9 113 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ATAD3CQ5T2N8 411 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 CASC10Q5T4H9 136 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 PAMR1Q6UXH9 720 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 SSX6Q7RTT6 188 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF525Q8N782 197 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00469Q8N7U9 141 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM151AQ8WW52 585 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 TIMM29Q9BSF4 260 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 REEP1Q9H902 201 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 VAPAQ9P0L0 249 aa4.47□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 THSD7BQ9C0I4 1608 aa4.46□□□□□ -1.69
RABGGTB-209ENST00000473406 DENND4AQ7Z401 1863 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TOR1AO14656 332 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PGA5P0DJD9 388 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV3-43DP0DP04 118 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PGAM1P18669 254 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ATF6P18850 670 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PCK1P35558 622 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRLHRP49683 370 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 HCCSP53701 268 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPS1P60891 318 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 IFFO1Q0D2I5 559 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ST3GAL4Q11206 333 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SLAMF1Q13291 335 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PRPSAP1Q14558 356 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 QPRTQ15274 297 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MAPRE2Q15555 327 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SGCAQ16586 387 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KYAT1Q16773 422 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 GCSAMLQ5JQS6 135 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CHST4Q8NCG5 386 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10J6PQ8NGY7 276 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RHOXF1Q8NHV9 184 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 LRRC45Q96CN5 670 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF75AQ96N20 296 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 COPS4Q9BT78 406 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ANGPTL4Q9BY76 406 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB126Q9BYW3 111 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR11A1Q9GZK7 315 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CES1P1Q9UKY3 287 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa4.46□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF26BQ2KJY2 2108 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C1H1 209 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 H7C2Y5 167 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 hCG_2039718K7EN88 272 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 RDH16O75452 317 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A6P06703 90 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PGA4P0DJD7 388 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PGA3P0DJD8 388 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 CD37P11049 281 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB6P28072 239 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL2P36404 184 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf47Q569G3 176 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 NELFCDQ8IXH7 590 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51G1Q8NGK1 321 aa4.45□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms