RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460258.5

NOP56-204, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 4

Gene NOP56, Length 837 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-204ENST00000460258 LSM1O15116 133 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 FPR3P25089 353 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SLC6A1P30531 599 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SGCAQ16586 387 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 HIST3H3Q16695 136 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 OR5M8Q8NGP6 311 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 OR6S1Q8NH40 331 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 OR52P1PQ8NH57 321 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 RPS4Y2Q8TD47 263 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 CCDC115Q96NT0 180 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SPATA25Q9BR10 227 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C12orf10Q9HB07 376 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ABCB10Q9NRK6 738 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa9.92□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 IGHG1P01857 330 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 IFNA6P05013 189 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 NEFHP12036 1026 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ETFAP13804 333 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 MAGEA4P43358 317 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C10orf53Q8N6V4 93 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 COG8Q96MW5 612 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 TMEM100Q9NV29 134 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 VPS13DQ5THJ4 4388 aa9.91□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 H3BQF6 201 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 OR6A2O95222 327 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 LINC00032P0C843 101 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ECHS1P30084 290 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 CD200P41217 278 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ECH1Q13011 328 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 BLMHQ13867 455 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 PGS1Q32NB8 556 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ZNF260Q3ZCT1 412 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C10orf128Q5T292 105 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 RNF220Q5VTB9 566 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C1orf94Q6P1W5 598 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 C16orf89Q6UX73 402 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 RNF165Q6ZSG1 346 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 DYNAPQ8N1N2 210 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 SLC26A10Q8NG04 563 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 RAX2Q96IS3 184 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 CCL13Q99616 98 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 EPYCQ99645 322 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 PTTG3PQ9NZH4 202 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 TMEM216Q9P0N5 145 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa9.9□□□□□ -0.82
NOP56-204ENST00000460258 HSPG2P98160 4391 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 A0A1B0GWJ7 208 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 CCL24O00175 119 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 SLC2A10O95528 541 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 C1QCP02747 245 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 LPLP06858 475 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 NR2F1P10589 423 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 GSK3BP49841 420 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 LGALS4P56470 323 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 SLC7A5Q01650 507 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 FAM27BQ5VT28 67 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 HHATQ5VTY9 493 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 OR4F3Q6IEY1 312 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 NOXO1Q8NFA2 376 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 OR5J2Q8NH18 312 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 TUBB1Q9H4B7 451 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.89□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 A0A1B0GWA3 101 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 RNF13O43567 381 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 NDUFB3O43676 98 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 GLCEO94923 617 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 PTMSP20962 102 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 PRPS1L1P21108 318 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 LAP3P28838 519 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 IKZF1Q13422 519 aa9.88□□□□□ -0.83
NOP56-204ENST00000460258 ALG10BQ5I7T1 473 aa9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms