RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439961.2

SUMO1P3-201, Transcript of SUMO1 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene SUMO1P3, Length 304 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P3-201ENST00000439961 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 STK40Q8N2I9 435 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 NKAIN3Q8N8D7 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 COX18Q8N8Q8 333 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SPC24Q8NBT2 197 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR52E1Q8NGJ3 308 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR4D5Q8NGN0 318 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR1L1Q8NH94 360 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR1F12Q8NHA8 337 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RHEBL1Q8TAI7 183 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ENKURQ8TC29 256 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SCFD1Q8WVM8 642 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RNF133Q8WVZ7 376 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ZNF606Q8WXB4 792 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR5P3Q8WZ94 311 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OTUB2Q96DC9 234 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 IFT74Q96LB3 600 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 TTC25Q96NG3 672 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SERPINB12Q96P63 405 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KCNK16Q96T55 309 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 TCHPQ9BT92 498 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CENPOQ9BU64 300 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 FAIM2Q9BWQ8 316 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CXCL16Q9H2A7 254 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 LINC00574Q9H8X3 128 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ETNK2Q9NVF9 386 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RWDD2AQ9UIY3 292 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 NCAPD2Q15021 1401 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SSH2Q76I76 1423 aa-0.05□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PNPLA6Q8IY17 1366 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KIF16BQ96L93 1317 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 GABRR3A8MPY1 467 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 GPR89AB7ZAQ6 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 H3BQ85 93 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PLPP3O14495 311 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SDHDO14521 159 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 FCMRO60667 390 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SLC19A2O60779 497 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RAMP3O60896 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SMC2O95347 1197 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 NRASP01111 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 HRASP01112 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KRASP01116 189 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 MT-ND4P03905 459 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 GPR89BP0CG08 455 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR5H8P0DN80 308 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 THRAP10827 490 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CD37P11049 281 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ZNF708P17019 499 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CTRB1P17538 263 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 DNAJB1P25685 340 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 HTR1DP28221 377 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 LOXP28300 417 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CD1CP29017 333 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CCR1P32246 355 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RBM34P42696 430 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 OR1G1P47890 313 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SSR4P51571 173 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CCNG1P51959 295 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 CDH6P55285 790 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PLP1P60201 277 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 RPL23P62829 140 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 IFITM3Q01628 133 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 LIPEQ05469 1076 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PLCXD2Q0VAA5 305 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 AP1B1Q10567 949 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PDZK1IP1Q13113 114 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 SCGB2A2Q13296 93 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ILKQ13418 452 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 C1orf61Q13536 156 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 DGCR6Q14129 220 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 GGTA1PQ4G0N0 100 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 PDZD11Q5EBL8 140 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 ACSBG2Q5FVE4 666 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 FAM201AQ5SY85 155 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 C9orf135Q5VTT2 229 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 DNAJC24Q6P3W2 148 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 KCNIP4Q6PIL6 250 aa-0.06□□□□□ -2.42
SUMO1P3-201ENST00000439961 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa-0.06□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms