RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 DHDHQ9UQ10 334 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LRP12Q9Y561 859 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 HRH3Q9Y5N1 445 aa8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MEIOCA2RUB1 952 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PDGFAP04085 211 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 H2BFMP0C1H6 154 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 FAM157BP0CG42 384 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 KIR2DL3P43628 341 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SOX2P48431 317 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CYB561P49447 251 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 AP3S2P59780 193 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 BTG1P62324 171 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ACER2Q5QJU3 275 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 RAET1LQ5VY80 246 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LGALS14Q8TCE9 139 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 TRIM63Q969Q1 353 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PNPLA2Q96AD5 504 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 HAVCR1Q96D42 359 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GNRHR2Q96P88 292 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 NEDD4LQ96PU5 975 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ABHD1Q96SE0 405 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 GFI1Q99684 422 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MARVELD1Q9BSK0 173 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 PLEKHA1Q9HB21 404 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 ABI3Q9P2A4 366 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 STEAP1Q9UHE8 339 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.9□□□□□ -0.98
POLR1A-204ENST00000424089 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PNR3 127 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR2M5A3KFT3 312 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GABARAPH6UMI1 98 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CCNKO75909 580 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CLDN1O95832 211 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GSTT2BP0CG30 244 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PSKH1P11801 424 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CNR1P21554 472 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GRNP28799 593 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLC6A1P30531 599 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SFTPDP35247 375 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 DDOSTP39656 456 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RPS27P42677 84 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CCL11P51671 97 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAG2P55895 527 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TPTEP56180 551 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CLDN20P56880 219 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAB25P57735 213 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RAC3P60763 192 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FMODQ06828 376 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 C10orf128Q5T292 105 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 HES5Q5TA89 166 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR7E24Q6IFN5 339 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 FCRLAQ7L513 359 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SYT9Q86SS6 491 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 GPAT4Q86UL3 456 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CMTM4Q8IZR5 234 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 TOMM5Q8N4H5 51 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ASB5Q8WWX0 329 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 YIPF5Q969M3 257 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLAMF6Q96DU3 332 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ACTR6Q9GZN1 396 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 G6PC2Q9NQR9 355 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ANKRD10Q9NXR5 420 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 OR5V1Q9UGF6 321 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLC5A6Q9Y289 635 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 CACNG2Q9Y698 323 aa8.89□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0A6YYH2 397 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 A6NJ64 397 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ARGFXA6NJG6 315 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF878C9JN71 531 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPA2E9PIF3 369 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SLC17A2O00624 439 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 SSX4O60224 188 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MPZL1O95297 269 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 PNPP00491 289 aa8.88□□□□□ -0.99
POLR1A-204ENST00000424089 MAS1P04201 325 aa8.88□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms