RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377244.7

SNX15-202, Transcript of sorting nexin 15, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX15, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15-202ENST00000377244 GSG1Q2KHT4 349 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 WDR31Q8NA23 367 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 BRD7Q9NPI1 651 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 SLC17A5Q9NRA2 495 aa22.14■■□□□ 1.14
SNX15-202ENST00000377244 A0A1B0GUH1 482 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 UBL3O95164 117 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 HSD11B1P28845 292 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CHRNB4P30926 498 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CCKARP32238 428 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 HTR5AP47898 357 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 RGS6P49758 472 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 DEGS2Q6QHC5 323 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ARL9Q6T311 187 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PPP1R14AQ96A00 147 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 S100PBPQ96BU1 408 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 MS4A3Q96HJ5 214 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 HDHD2Q9H0R4 259 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 COQ3Q9NZJ6 369 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa22.14■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 FAM208BQ5VWN6 2430 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 OR6C6A6NF89 314 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 F5H5K5 113 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ZNF254O75437 659 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 SLC2A1P11166 492 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CPEP16870 476 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 APEX1P27695 318 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ZNF584Q8IVC4 421 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PHC2Q8IXK0 858 aa22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 AGFG2O95081 481 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 HOXC12P31275 282 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 SLC3A1Q07837 685 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CDK5R1Q15078 307 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 RHOUQ7L0Q8 258 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 NAA40Q86UY6 237 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PRSS35Q8N3Z0 413 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 UFD1Q92890 307 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ISYNA1Q9NPH2 558 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 FRRS1LQ9P0K9 344 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CCL2P13500 99 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CD36P16671 472 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ARR3P36575 388 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 BDH1Q02338 343 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TPBGQ13641 420 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 C4orf17Q53FE4 359 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 GPR107Q5VW38 600 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TMEM53Q6P2H8 277 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 OR2G2Q8NGZ5 317 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 YIPF6Q96EC8 236 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 BOD1Q96IK1 185 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 WACQ9BTA9 647 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa22.12■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 NKX2-6A6NCS4 301 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 OR5H1A6NKK0 313 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CCRL2O00421 344 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CELA3BP08861 270 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 NR4A1P22736 598 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CRYGSP22914 178 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 CX3CR1P49238 355 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 HGFACQ04756 655 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ODF4Q2M2E3 257 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TMEM203Q969S6 136 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ZNF75AQ96N20 296 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 KCNJ15Q99712 375 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ACTR6Q9GZN1 396 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 SLC22A13Q9Y226 551 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 R4GMQ9 66 aa22.11■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 H3BSA7 217 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 KIR3DL2P43630 455 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TAS2R43P59537 309 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 WDR38Q5JTN6 314 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 C22orf34Q6ZV56 151 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 C17orf78Q8N4C9 275 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ZNF283Q8N7M2 679 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 FUNDC2Q9BWH2 189 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 FAM206AQ9NX38 181 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 LOC100509620A0A075B734 347 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 OGG1O15527 345 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 UGT2B10P36537 528 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 TGM4P49221 684 aa22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SNX15-202ENST00000377244 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms