RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 AP4S1Q9Y587 144 aa12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.75□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C17orf100A8MU93 164 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NDUFS8O00217 210 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NR4A2P43354 598 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CDK5Q00535 292 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM236Q5W0B7 351 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC27A4Q6P1M0 643 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FAHD1Q6P587 224 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ARL9Q6T311 187 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF786Q8N393 782 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR6K6Q8NGW6 343 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SNX33Q8WV41 574 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 YIPF5Q969M3 257 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NRBF2Q96F24 287 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PITX2Q99697 317 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CDADC1Q9BWV3 514 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KIF17Q9P2E2 1029 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KCNG2Q9UJ96 466 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FN1P02751 2386 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C2CD3Q4AC94 2353 aa12.74□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 H3BSA7 217 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SURF4O15260 269 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MITFO75030 526 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF823P16415 610 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 COL8A2P25067 703 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FASP25445 335 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MMP15P51511 669 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CCL8P80075 99 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PSG7Q13046 419 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GGTLC2Q14390 218 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM249Q2WGJ8 235 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PTP4A1Q93096 173 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OTULINQ96BN8 352 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ATF6BQ99941 703 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PTTG3PQ9NZH4 202 aa12.73□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ABCA1O95477 2261 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 F5H5K5 113 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SPARCP09486 303 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ACSM4P0C7M7 580 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF23P17027 643 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 USF1P22415 310 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ANOS1P23352 680 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GIFP27352 417 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 FMO3P31513 532 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ENTPD1P49961 510 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF81P51508 661 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CRISP1P54107 249 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RIPPLY3P57055 190 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RIN1Q13671 783 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DCXRQ7Z4W1 244 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NAA40Q86UY6 237 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HIPK1Q86Z02 1210 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PYDC1Q8WXC3 89 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 OR51V1Q9H2C8 321 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MSL2Q9HCI7 577 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GPR160Q9UJ42 338 aa12.72□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 INAFM1C9JVW0 142 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 EBAG9O00559 213 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SPRY3O43610 288 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RP2O75695 350 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV1-46P01743 117 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RGS6P49758 472 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TRIP10Q15642 601 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 MOGQ16653 247 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 TSTQ16762 297 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PCK2Q16822 640 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 SPRNQ5BIV9 151 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PLBD1Q6P4A8 553 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PARP8Q8N3A8 854 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 BBS1Q8NFJ9 593 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 DNAJC9Q8WXX5 260 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 RDH5Q92781 318 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 CMBLQ96DG6 245 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP12.71□□□□□ -0.37
CSAG1-201ENST00000361211 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 HIVEP2P31629 2446 aa12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP12.7□□□□□ -0.38
CSAG1-201ENST00000361211 LRP5LA4QPB2 252 aa12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms