RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 BOLA1Q9Y3E2 137 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 MYO9BQ13459 2157 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS4P43632 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 CCR9P51686 369 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 KIR2DS1Q14954 304 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 VASH2Q86V25 355 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 BPIFCQ8NFQ6 507 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 B4GALT1P15291 398 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 BSGP35613 385 aa20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 TCTN3Q6NUS6 607 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 S100A11P31949 105 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 NMES1Q9C002 83 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0B4J203 849 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A20A6NK97 555 aa20.33■□□□□ 0.85
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PTPRM-201ENST00000332175 ARIH2OSQ8N7S6 290 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 NDRG3Q9UGV2 375 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa20.33■□□□□ 0.85
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV3-27P01718 113 aa20.33■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 CHRM2P08172 466 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FOSL1P15407 271 aa20.33■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 OR10K2Q6IF99 312 aa20.33■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC25A46Q96AG3 418 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 BTAF1O14981 1849 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SSSCA1O60232 199 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ETHE1O95571 254 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 DBX2Q6ZNG2 339 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 PHYHIPQ92561 330 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CMC2Q9NRP2 79 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 A3GALT2U3KPV4 340 aa20.33■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SDK1Q7Z5N4 2213 aa20.33■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 LTB4R2Q9NPC1 389 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 NPAP1Q9NZP6 1156 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CSAG2Q9Y5P2 127 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 AIPO00170 330 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 RPS16P62249 146 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 TECTBQ96PL2 329 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 OR10A3P58181 314 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 DGCR2P98153 550 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 HMGN3Q15651 99 aa20.32■□□□□ 0.84
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PTPRM-201ENST00000332175 LYSMD1Q96S90 227 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO4Q9UKT5 387 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 GAB2Q9UQC2 676 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.32■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 NME2P1O60361 137 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM235A6NFC5 223 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 IAPPP10997 89 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 TMEM41BQ5BJD5 291 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 S1PR5Q9H228 398 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 PIAS2O75928 621 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 DFFBO76075 338 aa20.31■□□□□ 0.84
PTPRM-201ENST00000332175 CPEP16870 476 aa20.31■□□□□ 0.84
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