RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 TMEM235A6NFC5 223 aa18.74■□□□□ 0.59
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PTPRJ-208ENST00000615445 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 SPINT1O43278 529 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 EFSO43281 561 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 FADS1O60427 444 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 SCGB2A1O75556 95 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 WNT11O96014 354 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 MT-CO2P00403 227 aa18.7■□□□□ 0.58
PTPRJ-208ENST00000615445 PPP3CBP16298 524 aa18.7■□□□□ 0.58
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