RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601319.1

HERC3-214, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 1,298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-214ENST00000601319 CHID1Q9BWS9 393 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR2J1Q9GZK6 312 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 HDHD2Q9H0R4 259 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CHODLQ9H9P2 273 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 LHFPL6Q9Y693 200 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 U3KQV3 271 aa14.69□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 NCR1O76036 304 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ABHD16AO95870 558 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CST1P01037 141 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 NGFP01138 241 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 HPXP02790 462 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 IGHV4-31P0DP07 118 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ACHEP22303 614 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 GZMKP49863 264 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 MMP15P51511 669 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 BNIP1Q12981 228 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 FLOT2Q14254 428 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 GJC3Q8NFK1 279 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR52E2Q8NGJ4 325 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR1F12Q8NHA8 337 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CANT1Q8WVQ1 401 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RDH5Q92781 318 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 COG8Q96MW5 612 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TBC1D23Q9NUY8 699 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 KCNG2Q9UJ96 466 aa14.68□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 A8MV72 311 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RER1O15258 196 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CRLF1O75462 422 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ADH4P08319 380 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 LIPAP38571 399 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 MPV17P39210 176 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RGS6P49758 472 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CHN2P52757 468 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC36A3Q495N2 470 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZMAT1Q5H9K5 638 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR2T33Q8NG76 320 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR10G2Q8NGC3 310 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 HPS1Q92902 700 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 DDOQ99489 341 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 COQ7Q99807 217 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CYSLTR2Q9NS75 346 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TMEM160Q9NX00 188 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 POMPQ9Y244 141 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 MXRA5Q9NR99 2828 aa14.67□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 PLSCR5A0PG75 271 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RP2O75695 350 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 GPANK1O95872 356 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TFP02787 698 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 MAGEB1P43366 347 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CENPAP49450 140 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TEKQ02763 1124 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 MEP1BQ16820 701 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 FAM209AQ5JX71 171 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OTPQ5XKR4 325 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SLC18B1Q6NT16 456 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR2T4Q8NH00 348 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 GIPC3Q8TF64 312 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 FN3KQ9H479 309 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 YY1AP1Q9H869 796 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 YAE1D1Q9NRH1 226 aa14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 LYNX1G3V0Z9 82 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 LILRA1O75019 489 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 LYNX1P0DP58 116 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 GGT2P36268 569 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RASSF2P50749 326 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZNF81P51508 661 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 OR4Q3Q8NH05 313 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 YIPF5Q969M3 257 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 DIRC2Q96SL1 478 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 FEVQ99581 238 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 KLHL21Q9UJP4 597 aa14.65□□□□□ -0.06
HERC3-214ENST00000601319 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-214ENST00000601319 GSC2O15499 205 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-214ENST00000601319 SOX14O95416 240 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-214ENST00000601319 KITLGP21583 273 aa14.64□□□□□ -0.07
HERC3-214ENST00000601319 CRYBB2P43320 205 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms