RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF13O75888 250 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RPP14O95059 124 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMB10P40306 273 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFBR3Q03167 851 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 LY6DQ14210 128 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CNPY1Q3B7I2 92 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL24Q6TFL4 600 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A14Q7RTX9 510 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO17Q96EF6 278 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PGLYRP3Q96LB9 341 aa27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZZEF1O43149 2961 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RER1O15258 196 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TOXO94900 526 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GDI2P50395 445 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS25P62851 125 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2G2Q8NGZ5 317 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SFXN3Q9BWM7 321 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PROCRQ9UNN8 238 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 R4GMQ9 66 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTA1P02549 2419 aa27.22■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT11O96014 354 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SERPINA3P01011 423 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CD8BP10966 210 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSSP25774 331 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP16P51512 607 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXF2Q12947 444 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ECH1Q13011 328 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF13Q15543 124 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC36A2Q495M3 483 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ELFN2Q5R3F8 820 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ANKRD16Q6P6B7 361 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA1Q6PCB0 445 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SPATC1Q76KD6 591 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3GL3Q99963 347 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 HDHD2Q9H0R4 259 aa27.21■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GLI4P10075 376 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC3A1Q07837 685 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB35Q15286 201 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 PCSK4Q6UW60 755 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 SKA3Q8IX90 412 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 GHSRQ92847 366 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 STARD4Q96DR4 205 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ATF6BQ99941 703 aa27.2■■□□□ 1.95
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM212A6NML5 194 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GPX5O75715 221 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CGAP01215 116 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 APOC1P02654 83 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ITGA5P08648 1049 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NR4A1P22736 598 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD11B1P28845 292 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 BTLAQ7Z6A9 289 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR1K1Q8NGR3 316 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 BOD1Q96IK1 185 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED9Q9BVK6 235 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 COMMD4Q9H0A8 199 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 MOB1AQ9H8S9 216 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 PLEK2Q9NYT0 353 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FRRS1LQ9P0K9 344 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SGCEO43556 437 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 IL18BPO95998 194 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF32P17041 273 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC36Q8IYA8 594 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM203Q969S6 136 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C4orf45Q96LM5 186 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNJ15Q99712 375 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ATPIF1Q9UII2 106 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF281Q9Y2X9 895 aa27.19■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CASP6P55212 293 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 YIF1BQ5BJH7 314 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 BEND4Q6ZU67 534 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 CATSPERDQ86XM0 798 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 KBTBD8Q8NFY9 601 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AK2Q8NH90 309 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B8Q92506 261 aa27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C45A6NMZ5 311 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 ATE1O95260 518 aa27.17■■□□□ 1.94
CAPNS1-206ENST00000588815 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
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