RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	B9D1	Q9UPM9	204 aa		18.51	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HIST1H1C	P16403	213 aa	Known RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBG1	P23258	451 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LIPA	P38571	399 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LMO4	P61968	165 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MTX3	Q5HYI7	312 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	USP51	Q70EK9	711 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4C15	Q8NGM1	316 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IFT27	Q9BW83	186 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM15	Q9C019	465 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DECR2	Q9NUI1	292 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CACNG2	Q9Y698	323 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		18.5	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PLSCR5	A0PG75	271 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200		B4DSR2	109 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RER1	O15258	196 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRY3	O43610	288 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IDH3B	O43837	385 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TF	P02787	698 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SRD5A1	P18405	259 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CALB2	P22676	271 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A2	Q01362	244 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TEK	Q02763	1124 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MEP1B	Q16820	701 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LCN8	Q6JVE9	175 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LEG1	Q6P5S2	330 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NPEPL1	Q8NDH3	523 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4K13	Q8NH42	304 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NARFL	Q9H6Q4	476 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM157A	C9JC47	383 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DYNC1I1	O14576	645 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CD55	P08174	381 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DNM1P34	Q6PK57	102 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RINL	Q6ZS11	566 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	JAZF1	Q86VZ6	243 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC197	Q8NCU1	140 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MUC13	Q9H3R2	512 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TREM2	Q9NZC2	230 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	STARD10	Q9Y365	291 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		18.49	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR6C68	A6NDL8	312 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	UBOX5	O94941	541 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DBH	P09172	617 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HNF1A	P20823	631 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	KITLG	P21583	273 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	COX10	Q12887	443 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SPRN	Q5BIV9	151 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DDO	Q99489	341 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	MSL2	Q9HCI7	577 aa		18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	18.48	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200		J3QW42	95 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TNFRSF11B	O00300	401 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	REN	P00797	406 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTM3	P21266	225 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CDK5R2	Q13319	367 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DHFR2	Q86XF0	187 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	LINC00471	Q8N535	108 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GJC3	Q8NFK1	279 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CMBL	Q96DG6	245 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	DIRC2	Q96SL1	478 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	IL20	Q9NYY1	176 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		18.47	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	BHLHE40	O14503	412 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	GAST	P01350	101 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	NOS3	P29474	1203 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	HFE	Q30201	348 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		18.46	■□□□□ 0.55
PPP4C-205	ENST00000563200	AVPI1	Q5T686	147 aa		18.46	■□□□□ 0.55

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