RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM54	Q969K7	222 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF845	Q96IR2	970 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF385A	Q96PM9	386 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TRIB1	Q96RU8	372 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DOK1	Q99704	481 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DCUN1D5	Q9BTE7	237 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TMED9	Q9BVK6	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf198	Q9H425	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	NIPAL2	Q9H841	368 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SP140L	Q9H930	580 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	RNF122	Q9H9V4	155 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CALHM2	Q9HA72	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	SIAE	Q9HAT2	523 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CENPM	Q9NSP4	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	GALNT8	Q9NY28	637 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PMF1-BGLAP	U3KQ54	211 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GTH9	108 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PPW3	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF879	B4DU55	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CASK	O14936	926 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLPP2	O43688	288 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ARL6IP5	O75915	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GPANK1	O95872	356 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CD1A	P06126	327 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ADRA2A	P08913	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SFTPC	P11686	197 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GABRA1	P14867	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ABO	P16442	354 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MYL9	P24844	172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	S100A5	P33763	92 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PTGS2	P35354	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PLA2G5	P39877	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CD79B	P40259	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PSMB10	P40306	273 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SELENOP	P49908	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GDI2	P50395	445 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	PER3	P56645	1201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NCS1	P62166	190 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MRPS34	P82930	218 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RBPJ	Q06330	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SCRN3	Q0VDG4	424 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NFATC3	Q12968	1075 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ECH1	Q13011	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	AQP6	Q13520	282 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SPCS2	Q15005	226 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CDK5R1	Q15078	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	STK11	Q15831	433 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ETFDH	Q16134	617 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SSX1	Q16384	188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CTF1	Q16619	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	MEP1B	Q16820	701 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FBLN7	Q53RD9	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF585A	Q6P3V2	769 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LRRN1	Q6UXK5	716 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	LINC00346	Q8IVM7	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM123	Q8N131	208 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZFP41	Q8N8Y5	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	TEX19	Q8NA77	164 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ABHD3	Q8WU67	409 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	AP3S1	Q92572	193 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	GHSR	Q92847	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	SPTSSA	Q969W0	71 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATL1-208	ENST00000556067	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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